PCR产物的TA克隆 (DNA的胶回收和连接)

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PCR产物的TA克隆 (DNA的胶回收和连接)

2024-01-18 11:56| 来源: 网络整理| 查看: 265

(一)胶回收试剂盒回收PCR产物(以Omega公司 Gel Extraction Kit为例)

1.当目的片段DNA完全分离时,转移凝胶至紫外灯上尽可能快地切下目的片段。 2.凝胶块转移至1.5ml离心管(离心管已经称重了)中,称重得出凝胶块的重量。近似地确定其体积(假设其密度为1g/ml)。加入等体积的Binding Buffer(XP2),于55-65℃水浴中温浴7min或至凝胶完全融化,每2-3 min振荡混合物。(在凝胶完全溶解之后,注意凝胶-Binding buffer混和物的pH值。如果其pH值大于8的话,DNA的产量将大大减少。如果是橙色或红色,则要加入5μl 浓度为5 M,pH为5.2的醋酸钠,以调低其pH值。该混合物的颜色将恢复为正常的浅黄色。) 3.取一个干净的HiBind DNA Mini柱子装在一个干凈的2ml收集管内(已备好)。 4.将第三步获得的DNA/熔胶液全部转移至柱子中。室温下10,000 x g离心1分钟。弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内收集管。 5.如果DNA/凝胶熔液的体积超过700ul,一次只能转移700ul至柱子中,余下的可继续重复第5步至所有的溶液都经过柱子。每一个Hibind DNA回收纯化柱都有一个极限为25μg DNA的吸附能力。如果预期产量较大,则把样品分别加到合适数目的柱子中。 6.弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内收集管。转移300μl Binding Buffer(XP2)至柱子中,室温下, 10,000 x g下离心1min。 7.弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内收集管。转移700μl SPW Wash buffer(已用无水乙醇稀释的)至柱子中。室温下10,000xg离心1min。(浓缩的SPW Wash Buffer在使用之前必须按标签的提示用乙醇稀释。如果DNA洗涤缓冲液在使用之前是置于冰箱中的,须将其拿出置于室温下)。 8.重复用700μl SPW Wash buffer洗涤柱子。室温下10,000xg离心1min。 9.弃收集管中的滤液,将柱子套回2ml收集管内收集管。室温下,13,000 x g离心2 min以甩干柱子基质残余的液体。 10.把柱子装在一个干凈的1.5ml离心管上,加入15~30μl(具体取决于预期的终产物浓度)的Elution Buffer(或TE缓冲液)到柱基质上,室温放置1min, 13,000xg离心1min以洗脱DNA。第一次洗脱可以洗出70-80%的结合DNA。 如果再洗脱一次的话,可以把残余的DNA洗脱出来,不过那样的浓度就会较低。

(二)连接反应(以Takara公司pMDTM18-T Simple Vector Kit为例)

1)在微量离心管中配制下列DNA溶液,全量为5 μl。 pMDTM18-T Simple Vector 1 μl Insert DNA 0.1 pmol~0.3 pmol dH2Oup to 5 μl 2)加入5 μl(等量)的 Solution I。 3)16℃反应30分钟。(2 kbp以上长片段PCR产物进行DNA克隆时,连接反应时间请延长至数小时)。 4)全量(10 μl)加入至100 μl 感受态细胞中,冰中放置30分钟。 5)42℃加热45秒钟后,再在冰中放置1分钟。 6)加入890 μl LB培养基,37℃振荡培养60分钟。 7)在含有X-Gal、IPTG、Amp的LB琼脂平板培养基上培养,形成单菌落。计数白色、蓝色菌落。 8)挑选白色菌落,鉴定载体中插入片段的长度大小。



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