2021年3月22日，复兴号智能动车组首次招标，共17组，其中包括17辆编组4组、8辆编组7组、8辆高寒6组。

CR400AF-Z在CR400AF-C的基础上根据实际线路运行状况进行优化改进，司机室门玻璃的造型优化，面积更大。同时对客舱服务水平进行升级。

2021年06月25日，CR400AF-Z投入运营。

2022年06月15日，CR400AF-Z-0211/2出厂交付南昌局集团。

2022年12月，CR400AF-Z交付广州局集团。

2023年03月12日，CR400AF-Z交付济南局集团。

根据上线运用一年以来的反馈，新一批次的智能动车组进行了如下调整：

1、取消自动售货机，更改为储藏柜；

2、增加了观光区走廊的宽度；

3、端部一等座椅扶手增加小桌板、将腿靠重新造型；

4、商务座椅增加行李绑带；

5、无障碍设施车盲文贴纸增加高度。

2021年06月25日起：

CR400AF-Z-2251、CR400AF-Z-2252两组配属于北京局集团，在北京-西安（京广-徐兰）运营。

G55（北京西-石家庄-郑州东-西安北）

G60（西安北-郑州东-石家庄-北京西）

CR400AF-Z-2253为原CR400AF-C-0209改造并改号，配属于成都局集团，在成渝高铁运营。

G8602（重庆西06:52-内江北07:31/34-成都东08:08）

G8605（成都东08:35-重庆北09:52）

G8612（重庆北10:12-永川东10:44/47-成都东10:38）

G8615（成都东12:00-内江北12:35/37-隆昌北12:47/49-沙坪坝13:18）

G8622（沙坪坝14:00-成都东15:02）

G8673（成都东15:29-永川东16:20/22-重庆北16:54）

G8674（重庆北17:20-内江北18:09/11-资阳北08:29/31-成都东18:53）

G8635（成都东19:25-资阳北19:47/51-大足南19:22/26-重庆西20:53）

2022年06月20日起：

交路1：

G66（武汉07:40-郑州东09:13/16-石家庄10:32/34-北京西11:35）

G67（北京西12:05-石家庄13:06/08-郑州东14:23/26-武汉16:00）

G526（武汉16:24-信阳东-驻马店西-漯河西-郑州东-新乡东-安阳东-邯郸东-邢台东-石家庄-保定东-北京西22:17）

G65（北京西09:05-郑州东11:16/19-武汉12:53）

G70（武汉13:40-郑州东05:13/16-北京西17:28）

G69（北京西18:00-石家庄19:01/03-郑州东20:18/21-武汉21:55）

交路2：

D5818/9（武汉06:41-汉口07:00/05-潜江07:56/58-宜昌东08:58）

G802（宜昌东09:36-汉口11:22/28-郑州东13:07/10-石家庄14:26/29-北京西15:30）

G803（北京西16:00-保定东16:35/37-石家庄17:09/11-郑州东18:36/37-襄阳东20:16）

G804（襄阳东08:34-郑州东10:14/17-北京西12:29）

G801（北京西13:05-石家庄14:06/08-郑州东15:23/26-汉口17:07/12-宜昌东18:58）

D5820/17（宜昌东19:20-荆州19:55/57-潜江20:23/25-天门南20:45/47-汉口21:22-2150-武汉22:13）

2023年起列车在更多线路上线运行。

2023年04月26日起，复兴号智能动车组将首次亮相胶济客专、济青高铁，担当青岛至北京间G1066/G1073次、G206/G209次、G214/G201次、G1070/G1079次列车，最快旅行时间2小时59分，为往返胶东半岛旅游出行的旅客，提供更加舒适便捷的乘车体验。