置换检验 |
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1 置换检验 置换方法和参数方法都计算了相同的t统计量。但置换方法并不是将统计量与理论分布进行比较,而是将其与置换观测数据后获得的经验分布进行比较,根据统计量值的极端性判断 是否有足够的理由拒绝零假设。 R目前有一些非常全面而复杂的软件包可以用来做置换检验。本节剩余部分将关注两个有用 的包:coin和lmPerm包。coin包对于独立性问题提供了一个非常全面的置换检验的框架,而lmPerm包则专门用来做方差分析和回归分析的置换检验。 2 用 coin 包做置换检验 对于独立性问题,coin包提供了一个进行置换检验的一般性框架。通过该包,你可以回答 如下问题: q 响应值与组的分配独立吗? q 两个数值变量独立吗? q 两个类别型变量独立吗? 相对于传统检验,提供可选置换检验的coin函数
在coin函数中,y和x是数值变量,A和B是分类因子,C是类别型区组变量,D和E是有序因子,y1和y2是相匹配的数值变量。 上表中列出来的每个函数都是如下形式: function_name( formula, data, distribution= ) formula描述的是要检验变量间的关系; q data是一个数据框; distribution指定经验分布在零假设条件下的形式,可能值有exact、asymptotic和approximate。若distribution="exact",那么在零假设条件下,分布的计算是精确的(即依据所有可能的排列组合)。当然,也可以根据它的渐进分布(distribution="asymptotic")或蒙特卡洛重抽样(distribution="approxiamate(B=#)")来做近似计算,其中#指所需重复的次数。distribution="exact"当前仅可用于两样本问题。 2.1 独立两样本和 K 样本检验 (1)独立样本传统t检验 install.packages("coin") library(coin) score |
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