什么是遗传图谱和物理图谱 |
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1.
什么是遗传图谱和物理图谱?两者的异同是什么?遗传图谱在基因组研究中的意义何 在?
答:遗传图谱:某一物种的染色体图谱(也就是我们所知的连锁图谱) ,显示所知的基因和 / 或遗传标记的相对位置, 而不是在每条染色体上特殊的物理位置。 采用遗传学分析方法将基 因或其它 DNA 标记按一定的顺序排列在染色体上,这一方法包括杂交实验,家系分析。标 记间的 距离 (遗传图距) 用减数分裂中的交换频率来表示, 单位为厘摩 (Centi-Morgan, cM), 每 单位厘摩定义为 1% 交换率。遗传学图谱的解像度(分辨率)低,大约只能达到 100 万碱基 对 (1Mb) 的水平。
物理图谱:顾名思义,是 DNA 中一些可识别的界标(如限制性酶切位点、基因等)在
DNA 上的物理位置,图距是物理长度单位,如染色体的带区、核苷酸对的数量等。
两者异同:
①
遗传图谱是基于重组频率,物理图谱是基于直接测量的 DNA 结构。
②
减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和 / 或突 变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时,遗传图谱和物理地图并排排列时。
③
遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离,以重组值表示,单位 CM ④
物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离,距离的单位为长度单位,如 μ m 或者 碱基对数( bp 或 kp )等。
意义: 通过遗传图谱, 我们可以大致了解各个基因或 DNA 片断之间的相对距离与方向, 如哪 个基因更靠近着丝粒, 那个更靠近端粒等。 遗传图谱不仅是现阶段定位基因的重要手段, 即 使在人类基因组全物理图谱建立起来之后,它依然是研究人类基因组遗传与变异的重要手 段。
2.
基因组和转录组有什么对应关系?两者的差异何在?
答:
对应关系: 基因组是指一种微生物 (包括细菌和病毒) 或其它生物体细胞中的总
DNA 或 RNA( 是指逆转录病毒 ), 包括核 DNA ,细胞器 DNA( 动植物线粒体 DNA 和植物叶绿体 DNA) 和染色体外遗传成分 ( 如细菌的质粒 DNA) 。
转录组即一个活细胞所能转录出来的所有 mRNA 。研究转录组的一个重要方法就是利用 DNA 芯片技术检测有机体基因组中基因的表 达。从基因组 DNA 转录的基因总和,即转录组,也称味表达谱,是研究细胞表型和功能的 一个重要手段。
在生物系统中,基因组是遗传信息的储存体, mRNA( 转录组 ) 是基因表达的 中间体,功能性蛋白质 ( 蛋白质组 ) 是基因功能的执行体。
差异:
①
基因组是一个十分稳定的体系,同一种系不同个体之间的染色体数目是相同的,各染色 体上有相同数量的基因和基因分布,也有基本相同的核苷酸顺序,即基因组是一个相对 静态的概念,一个有机体从它的发生、发展到衰老、死亡,不同细胞、组织和器官的基 因组是基本稳定不变的。
②
转录组和基因组水平不同,转录组是高度动态的,当细胞受到侵犯时,甚至当细胞处于 正常的生理活动如复制,分裂时,基因的转录情况也会变化很大,产生不同的转录组。
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