实验操作喂饭教学

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实验操作喂饭教学

2024-04-20 17:30| 来源: 网络整理| 查看: 265

提取细胞总RNA

①在显微镜下观察细胞生长状态,并将实验中所需要的试剂预先放进冰箱中预冷。用磷酸盐缓冲液清洗细胞表面,目的是为了减少培养基中的成分对提取总RNA的干扰,以6孔板为例,该操作要小心细致,每孔加入1 ml磷酸盐缓冲液,注意将磷酸盐缓冲液打到6孔板侧壁上,不要直接冲击细胞,以免造成细胞损耗,轻轻晃动6孔板使细胞清洗充分,弃去磷酸盐缓冲液。该操作予以3次重复。

②吸净磷酸盐缓冲液,避免磷酸盐缓冲液稀释Trizol。Trizol放入4℃冰箱预冷,向6孔板内每孔加入1 ml的Trizol裂解细胞,若用12孔板提取细胞,则每孔加入500 ul的Trizol。将6孔板置于冰上15 min,也可以放置于4℃实验室摇床上摇动10 15 min,加速其裂解,等到充分裂解细胞后,肉眼可见Trizol更加浓稠,用无酶枪头将细胞吹打下来,此过程中注意个人防护,Trizol有腐蚀性,因此注意动作轻柔,保护好裸露在外的皮肤。

③将细胞裂解液转移至1.5 ml无酶EP管中,每孔1 ml 的Trizol加入200 ul的氯仿,如果用12孔板,每孔500 ul的Trizol加入100 ul氯仿。剧烈震荡混匀30 sec,冰上静置15 min。

④离心机调至4℃预冷,在4℃下12 000 rpm/min离心15 min。

⑤将EP管从离心机中取出,注意动作轻柔,此时EP管内液体分层明显,上层无色水样液体,含RNA。用无酶枪头小心吸取上层无色液体,注意不要触及中间分界的白色和下层红色液体,如果吸力太大可以用黄色枪头套白色枪头,减小吸力。将无色上清液转移至新的无酶EP管中,该操作要小心轻柔,如果一旦触及混合层,或者吸力太大,将液体再次离心分层即可。记录吸取的液体量,以免对后续实验造成影响。

⑥在前期准备中,预先将异丙醇放入4℃冰箱预冷,以免对RNA的提取造成影响,使RNA降解。向无酶EP管中加入与上清液等体积的异丙醇,轻柔混匀15 sec,冰上静置15 min。该步骤可以根据实验需要,混匀后放入-30 ℃冰箱进行过夜沉淀。

⑦离心机调至4℃预冷,在4℃下12 000 rpm/min离心15 min。

⑧将EP管从离心机中取出,注意动作轻柔,此时EP管内底部有少许白色沉淀,弃去上清液。无水乙醇放入4℃冰箱预冷,用DEPC水稀释成75%乙醇。每只EP管中加入1 ml的75%乙醇,用无酶枪头将沉淀吹起悬浮洗涤,如果吸力太大可以用黄色枪头套白色枪头,减小吸力,注意不要吸走沉淀。离心机调至4℃预冷,在4℃下12 000 rpm/min离心15 min。弃去上清液,再次向每只EP管中加入1 ml的75%乙醇,重复洗涤步骤,再次离心。

⑨弃去上清液,将EP管倒扣放在干净纸巾上,用干净棉签小心擦去EP管内残留75%乙醇,注意不要擦去沉淀,静置10 min。根据RNA沉淀量加入适量DEPC水混匀,轻柔吹打,溶解RNA。在EP管上标记提取时间、细胞名称、EP管编号、实验人员姓名等基本信息。

2) 检测RNA的含量和纯度

①打开NANO DROP 2000系统,用1 ul 的DEPC水洗涤分光光度计,该操作重复3次。每管上样1 ul的RNA样品,测定RNA浓度和纯度。通过在260 nm和280 nm处的光密度值(OD)计算RNA的含量和纯度。

②RNA最好逆转录后以cDNA的形式储存。若暂不逆转录,则将RNA冻存于﹣80℃冰箱,避免反复冻存造成RNA降解。



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