1990年世界杯之后，马拉多纳消沉过很久，在那不勒斯吸毒令他被禁赛15个月。1994 年世界杯，与希腊队比赛中，马拉多纳通过和队友眼花缭乱的团队配合打入一粒精彩的大力远射。之后对尼日利亚，马拉多纳用一个任意球快发助攻卡尼吉亚破门。但此后，马拉多纳在例行药检中被查出服用了禁药麻黄素成分(虽然马拉多纳后来在自传中说是自己的私人教练给他喝了功能饮料，但也可能是吸毒所致)，国际足联将其踢出世界杯赛场。失去马拉多纳的阿根廷队军心大挫，此后两场皆负，1/8决赛被淘汰。

1994年世界杯后的马拉多纳曾短暂执教过，成绩一般。一位同行在评价马拉多纳执教时说，马拉多纳总试图让队员完成那些只有他自己才可能完成的技术，这显然是不可能的。1995年马拉多纳在博卡队复出，由于长时间吸毒、停赛，加上无法节制的社交生活，马拉多纳的状态已经有所下滑，但也时常有精彩发挥，直至1997年马拉多纳最终宣布挂靴，结束其璀璨的球员生涯。2010年世界杯，马拉多纳率领阿根廷征战南非，那个无比风光的球王似乎又回来了。

马拉多纳被认为是二十世纪最伟大的足球运动员，他不仅拥有南美球员精准的脚法和极其娴熟的带球技术，大局观也非常出色，在任何一支球队，他都是绝对灵魂，可以将球队整体盘活。可惜马拉多纳在个人行为和私生活方面皆受到非议。如有传他早在效力巴塞罗那时曾染上毒瘾，而这亦被指为遭巴塞罗那开除的原因。在那不勒斯因风流成性而拥有一个私生子亦是一个公开的秘密，一半是天使，一半是魔鬼，是对马拉多纳人生最好的诠释。