没想到吧？多组间取交集，除了韦恩图，还有这个UpSet！新年get个SCI装逼小技巧！

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没想到吧？多组间取交集，除了韦恩图，还有这个UpSet！新年get个SCI装逼小技巧！

2024-06-11 01:48| 来源: 网络整理| 查看: 265

韦恩图和UpSet图

小伙伴们，大家好！又到了小洋专栏的时间，这一期，小洋将向大家介绍如何利用仙桃学术工具来绘制韦恩图和UpSet图。

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基本概念

韦恩图：用 2 个或者多个圆形或者椭圆形进行重叠，分别展示不同组之间共有和特有的部分情况。韦恩图比较适合于展示 2-5 个分组之间的交集和独有的情况。

UpSet 图：用于展示不同组之间共有和特有部分的一种可视化方式，是韦恩图的另外一种替代方式。韦恩图比较适合 2-5 组的分析和可视化，而超过5组时，韦恩图已经很难完成，此时可以用 UpSet 图来进行分析和可视化。UpSet图也可以进行少于5组的分析和可视化。用于展示数据的变化趋势情况。

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应用场景

韦恩图：韦恩图主要用于展示 2-5 个分组之间的共有和独有的情况。比如：

1. 多个不适合放一起分析的数据集分别进行差异分析后，用韦恩图取各个数据集共有的差异基因。

2. 已有一个分子列表，与某个数据库中的分子列表的重合情况。

UpSet 图：主要用于展示 3-7 组（目前设置最大的是7组）之间的共有和独有的情况。比如：

1. 多个数据集分析后的差异分子列表共有和特有的情况。

2. miRNA 多个数据库分析后的结果。

结果解读

韦恩图

韦恩图主要为几个圆形或者椭圆形重叠展示。

一般有多少个分组，就有多少个圆形或者椭圆形。

每个部分的数字代表具体分组和分组共有的数目有多少。

韦恩图主要为几个圆形或者椭圆形重叠展示。

一般有多少个分组，就有多少个圆形或者椭圆形。

每个部分的数字代表具体分组和分组共有的数目有多少。

UpSet图

UpSet 图主要包含 3 个部分：

上部分为各个分组独有和共有的数量，比如第一个柱子代表在col5分组独有5个，第6个柱子为col5分组、col4分组和col3分组共有但是其他组没有的数量，共1个。下部分为各个分组独有和共有的分类情况，分别对应上部分的柱子，连线代表共有，比如第6列代表col5分组、col4 分组和col3分组共有但是其他组没有。左部分（或者右部分）代表各个分组中包含的没有重复的元素数量。

以上就是有关韦恩图和UpSet图的背景介绍，如果想要进一步掌握韦恩图和UpSet图的相关内容，还可以登录解螺旋官方网站进行深入的学习和探索！

实战演练

下面让我们来看一篇2020年3月发表在“ Scientific reports”（ IF= 4.379）杂志上的一篇文章。题名为“ MicroRNA hsa-mir-3923 serves as a diagnostic and prognostic biomarker for gastric carcinoma”。