塔吉克斯坦的地理因山和河流的突出而显独特。几乎整个地区都被土地覆盖（超过 90％），并且以多山为标记。这些山包括帕​​米尔高原的高耸范围，以及含有海拔高度在300米至7495米之间高峰的天山山脉。

帕米尔是从山隘和峡谷穿凿而出的几条奔流河流的源头。塔吉克斯坦的地理还包括在其境内的947条河流，绵延 10公里。除了瓦赫什河和喷赤河 ，其中最长的是阿姆河，锡尔河，和泽拉夫尚河。

塔吉克斯坦还包含了众多湖泊，其中最大的是卡拉库尔湖（在帕米尔东部），是咸水湖，总面积 380平方公里。萨雷兹湖（在西帕米尔）是最深的湖， (深490米），面积有86.5平方米，这是一个淡水湖泊。

塔吉克斯坦的山以其冰川著名，可能是亚洲最大的。费琴科冰川（77公里长， 1,700 - 3,100公尺宽）是帕米尔最大的。 泽拉夫尚冰川是另一个。希萨尔的阿莱（南天山）山脊是塔吉克斯坦地理的中心，许多山脉的高度都超过 5000米。塔吉克斯坦首都杜尚別，位于希萨尔山麓的希萨尔河谷。

帕米尔山脉在塔吉克斯坦东南部。最低的隘口恰巧是 Kamaloyak（4,340米）。帕米尔所知的最高峰，为共产主义峰，是目前熟知的伊斯梅尔萨马尼山峰 （7,495米）。无数的悬冰川构成了一个令人印象深刻的场景。

在塔吉克斯坦西北部，你会发现好几个其他的山脊。土耳其斯坦山（雪线在3,500-4,000米开始），泽拉夫尚山和希萨尔山是其中几个。

塔吉克斯坦北部为费尔干纳空心所占据，它被Kuramin山岭，瓦赫什和希萨尔平原，以及Golodnaya（饥饿）草原围住。