一般情况下，青霉素和青蒿素的区别主要在于适应症不同、不良反应不同，具体分析如下：

1.适应症不同：青霉素是一种抗生素，有抗感染、抗病毒、杀菌、消炎的功效，主要用于革兰氏阳性菌所导致的各种感染，如毛囊炎、扁桃体炎、脓肿、菌血症等。青蒿素含有二氢青蒿素、蒿甲醚等有效物质，可杀灭疟原虫，对各型疟疾有很好的功效，如耐氯喹的重症恶性疟和脑型疟，在临床上是一种高效、速效、低毒的一种抗疟药。

2.不良反应不同：青霉素的过敏反应在临床上是比较常见的，如荨麻疹、白细胞减少、过敏性休克；部分患者还会出现毒性反应，如抽搐、昏迷；青蒿素也有一些不良反应，常见的有轻微恶心、呕吐、腹泻等；比较严重的还会出现皮疹、瘙痒、水泡、窒息、呼吸困难等症状。由于青蒿素有胚胎毒性，孕妇要谨慎食用，哺乳期妇女食用需要暂停哺乳。