北大张博士教你如何计算 IC50 |
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原标题:北大张博士教你如何计算 IC50 张浩然,北京大学药学博士,此前在生物学霸给大家分享了很多精彩内容,具体见文章底部,他还创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件,可点击阅读原文查看。 今天他手把手教教大家如何计算 IC50。 什么是 IC50 IC50(half maximal inhibitory concentration)又叫半抑制浓度,它能指示某一药物或者物质(抑制剂)在抑制某些生物程序(或者是包含在此程序中的某些物质,比如酶,细胞受体或是微生物)的半量。 在凋亡方面,可以理解为一定浓度的某种药物诱导肿瘤细胞凋亡 50%,该浓度称为 50% 抑制浓度,即凋亡细胞与全部细胞数之比等于 50% 时所对应的浓度,IC50 值可以用来衡量药物诱导凋亡的能力,即诱导能力越强,该数值越低,当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。 在间接竞争 ELISA 标准曲线中是一个非常重要的数据,标准曲线是一个 S 型曲线。 任务:绘制量效曲线,计算 IC50 IC50:半数抑制浓度(对应上图),Y 轴的研究指标随浓度递减。 EC50:半数有效浓度(对应下图),Y 轴的研究指标随浓度递增。 右图其实是把 Cell Inhibition 当成药物的效应,与药物浓度呈正相关。 其实对于细胞毒实验,两者是相等的。 如果药物有抑制细胞活性的作用,习惯上称之为 IC50(称呼而已)。 实例操作:细胞毒实验计算 IC50 展开全文细胞毒实验:SRB 法,MTT 法 细胞毒实验:SRB 法,MTT 法 阴性对照组 Control:给药浓度为 0 的含细胞的孔,实验中以该组细胞活力当成 100%。 阴性对照组 Control:给药浓度为 0 的含细胞的孔,实验中以该组细胞活力当成 100%。 空白组 Blank:无细胞的孔,用于吸光度的调零(扣掉 96 孔板自身的一点儿吸光度) 空白组 Blank:无细胞的孔,用于吸光度的调零(扣掉 96 孔板自身的一点儿吸光度) 拓展知识:计算 IC50 的其他方法 方法 1:前面已演示,用 Excel 计算 Mean,SD 和 N,转换成百分数后用 GraphPad 计算。注意选择 normalized Response-Variable slope。 方法 2:XY→Use sample data→Dose response,直接将吸光度值输入 GraphPad 近似计算。选择 response-Variable slope。(快速,但有近似,有主观成分) 方法 3:使用 SPSS,分析→回归→Probit。 方法 4:使用 Excel,对中间呈线性的几个点进行线性拟合,用线性方程来近似计算。(简易,但有近似,有主观成分) 张博士系列课程 作者:张浩然,经其授权转载 图片来源:张浩然 张浩然,男,北京大学药学博士,创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。 ↓↓↓返回搜狐,查看更多 责任编辑: |
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