FDR错误发现率 |
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转自:https://baike.baidu.com/item/FDR/16312044?fr=aladdin https://blog.csdn.net/taojiea1014/article/details/79681249 http://www.360doc.com/content/18/0914/21/19913717_786724085.shtml https://www.sohu.com/a/165109778_785442 https://www.jianshu.com/p/13f46bebebd4 1.定义FDR(false discovery rate),是统计学中常见的一个名词,翻译为伪发现率,其意义为是 错误拒绝(拒绝真的(原)假设)的个数占所有被拒绝的原假设个数的比例的期望值。 //FDR是个期望值 2.利用Benjamini–Hochberg方法计算FDR的计算及R语言实现FDR的计算相当简单,包括以下几步: 1.对p值进行从小到大的排序,标记上序号1~n; 2.其中,最大的FDR(不考虑重复则为第n位)等于最大的p值; 3.对于n-1位的FDR,取下面两者的较小值: 上一步(第n位)计算得出的FDR值; p值*n/(n-1) 4.不断迭代第三步(n-2,n-3....),直至计算到最小p值对应的FDR。 例子: temp c(3:1, 2:0, 4:2) [1] 3 2 1 2 1 0 4 3 2 #求从左到右累积的最小值。 #到第二个2出现时已经有了最小值是1,所以对应都是1. #到第一个0出现时,是最小值,那么对应之后再出现的4 3 2 累计最小值都是0.
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