FDR错误发现率

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FDR错误发现率

2024-07-13 14:41| 来源: 网络整理| 查看: 265

转自:https://baike.baidu.com/item/FDR/16312044?fr=aladdin  https://blog.csdn.net/taojiea1014/article/details/79681249

http://www.360doc.com/content/18/0914/21/19913717_786724085.shtml   https://www.sohu.com/a/165109778_785442

https://www.jianshu.com/p/13f46bebebd4

 1.定义

 FDR(false discovery rate),是统计学中常见的一个名词,翻译为伪发现率,其意义为是 错误拒绝(拒绝真的(原)假设)的个数占所有被拒绝的原假设个数的比例的期望值。

//FDR是个期望值

 2.利用Benjamini–Hochberg方法计算FDR的计算及R语言实现

FDR的计算相当简单,包括以下几步:

  1.对p值进行从小到大的排序,标记上序号1~n;

  2.其中,最大的FDR(不考虑重复则为第n位)等于最大的p值;

  3.对于n-1位的FDR,取下面两者的较小值:

上一步(第n位)计算得出的FDR值;

p值*n/(n-1)

  4.不断迭代第三步(n-2,n-3....),直至计算到最小p值对应的FDR。

例子:

temp c(3:1, 2:0, 4:2) [1] 3 2 1 2 1 0 4 3 2 #求从左到右累积的最小值。 #到第二个2出现时已经有了最小值是1,所以对应都是1. #到第一个0出现时,是最小值,那么对应之后再出现的4 3 2 累计最小值都是0.

 

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