核体系文库构建

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核体系文库构建

2024-07-11 20:32| 来源: 网络整理| 查看: 265

 

常见问题  

1. Gateway和Smart方法比较及如何选择?{xunruicms_img_title}

 

2. 欧易生物提供的酵母双杂文库有何特色? SMART 文库所需 RNA 总量低,可以进行均一化处理以降低基因的冗余。既可以提供文库质粒也可以提供酵母工作液和母液。文库可以用于单杂也可用于双杂,用于双杂既可以用共转也可以用 mating 的方法筛库。 Gateway 酵母文库需要总 RNA 量较高,但是采取分离 mRNA 的方法,不经过 PCR 过程所以不会导致基因过度冗余。除了初级文库、次级文库质粒和菌液以外我们同样可以提供酵母工作液和母液。文库可以用于单杂也可用于双杂,用于双杂既可以用共转也可以用 mating 的方法筛库。

 

3. 如何检测文库的库容、插入片段平均长度、重组率? 文库滴度(每毫升文库菌液库容量)的计算公式:

CFU/ml = 平板上的克隆数/平板上涂布菌液的体积 μl×n×1000μl 其中 n 是原始菌液的稀释倍数;总的文库库容(CFU)= CFU/ml ×文库菌液的总体积(ml)

插入片段平均长度:随机挑取 24 个菌落 PCR 所得到的插入片段长度的总和的平均值

重组率:根据菌落 PCR 中所有阳性插入片段的克隆在总检测克隆数中所占比例

4.送样要求有哪些?

total RNA:SMART法:≥1 µg;Gateway法:≥200 µg(OD 260/280 值应在 1.8 - 2.2 之间;Agilent 2100 score ≥ 7)

植物样本:> 5 g

动物样本:>1 g

细胞样本:>5*107 cfu

RNA 得率低或难抽提样本需酌情增多送样量

 

 



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