机械工程学院源于1985年建立的机械工程系，2008年撤系建院。从1985年起招收本科学生，现有本科专业5个，即：机械设计制造及其自动化、过程装备与控制工程、工业工程、机械电子工程、船舶与海洋工程；从2014年起招收硕士研究生，现有硕士授权学科1个，即：机械工程学科。

经过30年建设，机械工程学院已形成了一 支以 教授 和 博士领衔的学术梯队和教学团队，教授15人，博士学位教师23人，1名教师入选“教育部高等学校骨干教师资助计划”，1名教师入选江苏省“333工程“中青年科学技术带头人，3名教师入选江苏省“333工程”第三层次培养对象，5名教师入选江苏省“六大人才高峰”计划，1名教师入选江苏省“青蓝工程”跨世纪学术带头人培养人选，2名教师入选江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人培养对象，9名教师入选江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养对象。机械设计制造及其自动化专业为江苏省高等学校特色专业，机械类专业（包括机械设计制造及其自动化、过程装备与控制工程、机械电子工程）为江苏省“十二五”高等学校重点专业。从2012年起，机械设计制造及其自动化、过程装备与控制工程、工业工程、机械电子工程4个专业按机械工程大类培养，前4学期培养方案相同，第4学期末在大类内可以任选专业。机械工程学科为江苏省重点培育学科、硕士学位授权学科；机械制造及其自动化学科为江苏省重点建设学科；“海洋装备与材料”学科方向为江苏省优势学科“海洋科学与技术”学科方向之一；目前在机械工程学科（含机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计及理论、车辆工程）招收学术型硕士研究生。

建设有先进制造与装备实践教育中心（省级实践教育中心）、机电综合实践教学中心（省级实验教学示范中心）、数字化设计与制造实验室（中央财政支持地方高校发展专项资金）、船舶先进制造技术实验室（中央财政支持地方高校发展专项资金）、先进加工技术实验室（中央与地方共建）、测控技术实验室（中央与地方共建）、先进材料成形实验室（中央与地方共建）；与江苏省海洋资源开发研究院共建、共享“绿色过程与工程研发中心”、“海洋先进材料平台”、“分析测试中心”；与化学工程学院共建有江苏省学科综合训练中心“材料科学与工程学科综合训练中心”；建设有连云港市重点实验室“海洋资源利用功能材料”实验室，建设有校重点实验室“海洋新材料加工技术实验室”。建设了“连云港市装备制造产业技术研究院”、“连云港市海洋及船舶工程研发服务平台”、“连云港市CAD技术培训中心”，与连云港市海州区人民政府共建“国家火炬计划连云港装备制造特色产业基地”、“连云港市（海州）装备制造特色产业基地教育培训中心”。校外实习单位有中国一拖集团有限公司、中信重工机械股份有限公司、南京化工机械厂、徐州恒盛肥业有限公司等。

近5年来承担国家和省部级课题20余项，发表学术论文600余篇，被SCI、EI、ISTP检索200余篇，获国家发明专利20余项。学风建设成绩斐然，毕业生就业率、考研率高，在全国大学生英语、力学、数学建模、节能减排及江苏省大学生高等数学、大学物理、力学、机器人、机械创新设计、先进制造技术实习教学与创新制作、材料力学、物理及实验科技作品创新竞赛等各类学科竞赛中取得40余项一等奖、二等奖，有优秀校友已担任清华大学、北京理工大学等校博士生导师。