所以，你有转录因子ChIP-seq数据，预测转录因子功能完全可以交给Cistrome-GO做。

总的来说，通过Cistrome DB ，可以直接关键词搜索，也可以通过toolKit进行可以检索哪个因子调控了我们感兴趣的基因、结合在该区域；输入peak结果，查看哪些转录因子的结果与你的输入结果有明显的overlap，转录因子的colocation分析。Cistrome-GO还可以做转录因子ChIP-seq peak或者TF干扰表达的差异表达的功能富集分析，功能强大，下次可以用上。

Research:

Zheng R, Wan C, Mei S, Qin Q, Wu Q, Sun H, Chen CH, Brown M, Zhang X, Meyer CA, Liu XS. Cistrome Data Browser: expanded datasets and new tools for gene regulatory analysis. Nucleic Acids Res, 2018 Nov 20. Doi: 10.1093/nar/gky1094

Mei S, Qin Q, Wu Q, Sun H, Zheng R, Zang C, Zhu M, Wu J, Shi X, Taing L, Liu T, Brown M, Meyer CA, Liu XS. Cistrome data browser: a data portal for ChIP-Seq and chromatin accessibility data in human and mouse. Nucleic Acids Res, 2017 Jan 4;45(D1):D658-D662. Doi: 10.1093/nar/gkw983