已有 37759 次阅读 2014-5-8 13:46 |个人分类:Study everyday|系统分类:科研笔记

   •启动子: RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。•promoter自然不属于intron和Exon的任何一个，属于noncodingsequence。

        •noncoding RNA是现在研究的热点之一。我们常见的MiRNA,SiRNA,antisense RNA tech,这些都是属于ncRNA的范围。只要你在进一步问下：这些RNA是哪里来的？你就知道部分答案，跟那些看似跟编码蛋白没有关系的DNA序列有关系。这部分DNA有个统称就junk DNA，垃圾ＤＮＡ或者冗余DNA，他们编码的RNA就属于 ncRNA.RNAi就是迄今最经典的ncRNA功能典范。

        •An exon is asequence of DNA that is expressed (transcribed) into RNA and then often, butwith many noteworthy exceptions[1] , translated into protein. Adjacent exons maybe separated by an intron, which is later removed from the RNAtranscript via the splicing mechanism. (From Wikipedia)

        •UTR（UntranslatedRegions)即非翻译区，是信使RNA（mRNA）分子两端的非编码片段。 　

        •5'-UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子，3'-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的末端。

   转录（Transcription）是遗传信息从DNA到RNA的转移。即以双链DNA中的一条链为模板，以ATP、CTP、GTP和UTP4种核苷三磷酸为原料，在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。

常见问题：

问：Promoter在DNA序列中是算内含子还是外显子？

答：都不是。属于noncoding sequence。

问：UTR在DNA序列中是算内含子还是外显子？

答：外显子。

问：起始密码子ATG在gene的哪个位置？

答：外显子内，CDS以ATG开始。

问：每个基因之间都有一定的间隔序列，这些基因间的间隔序列应该不属于内含子吧？

答：是的。属于noncoding sequence。

问：如何寻找启动子区域和预测转录因子结合位点？

答：见帖子http://www.dxy.cn/bbs/topic/23466429

彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有图有真相).ppt