阅读量：

399

作者：

钟智

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摘要：

在翻译起始时,核糖体首先要与mRNA的5′非翻译区(5′untranslatedregion,5′UTR)的核糖体结合位点结合,因此5′UTR的序列特征对翻译起始的准确性和翻译的效率都有很大的影响。论文运用统计学方法讨论了在5′UTR中三联体AUG对翻译起始的可能影响。 论文的第一部分以细菌和古菌基因组的mRNA的5′UTR序列作为研究对象,分析了在5′UTR的3个不同阅读框架中三联体AUG的分布,发现无论是细菌还是古菌基因组都在阅读框1中有非常明显的AUG缺失(depletion)。与AUG在阅读框1出现明显的缺失相反,三联体UAA在起始密码子附近的频率有了显著的增加。AUG的缺失和UAA频率的增加可能会避免基因被错误地翻译起始,提高翻译效率。 论文的第二部分将5′UTR中的三联体AUG按照存在形式分类,发现绝大部分的AUG都是以uORF(upstream open reading frame)的形式出现的,uAUG(upstream AUG)的数量很少,特别是在阅读框1中。而且在细菌基因组的阅读框1中uAUG较多地出现在了含有SD序列的基因上游。比较发现,uAUG引导的序列在同义密码子使用上的偏好性较真正的编码序列差,这可能表明细菌和古菌在同义密码子使用上的偏好性也是决定基因准确的翻译起始的重要因素之一。

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关键词：

AUG缺失 翻译起始 密码子偏好 基因组

学位级别：

硕士

学位年度：

2008

DOI：

10.7666/d.y1376367

被引量：

3