这三种图形都属于色谱图，其中：TIC图和BPC图都可以反应样品的整体信息，但是有些学者认为BPC图不能反应样品真实的情况，所以很多文章中多使用TIC图反应样品中代谢物的情况。

到底如何提取这些代谢物的谱图信息，今天以Xcalibur 4.3 为例，和大家分享下如何用该软件提取代谢组文章中常用的谱图。在调取之前，我们需要有代谢组的原始数据。

# 调取样本TIC图#

1.1 打开原始数据，查看样本谱图信息

1.1.1软件安装完成之后，鼠标左键双击打开软件。勾选软件的Processing Setup按钮；

1.1.2在打开后的界面中，选择Qual Browser选项。选择之后再弹出的界面中选择File中的Open按钮，即可打开目标样本的代谢组原始文件。

图形中各参数信息表述如下：

原始数据路径和数据名称；

数据开始采集时间；

当前显示的离子流图中，最高峰的信号响应值

“TIC”：该图为TIC图；“MS”：该图为一级质谱图+二级质谱图一同参与绘制的离子流色谱图

样本名称

质谱图中的样本名称，#后面的数字表示谱图的编号

保留时间

该质谱图中响应强度最高的离子的响应值

该谱图为质谱图全扫描

质谱图的扫描范围

此时图形中展示的是样本中代谢物的TIC图和某一时间点下代谢物的质谱图。但现在谱图属于锁定状态，如果想一张图中同时展示多个样本的TIC图，或一张TIC图中包含多个样本的结果，则需要先将谱图激活，再进行后续的调整。

1.2 色谱图调整

1.2.1色谱图中点击右上角“图钉”按钮使之呈现绿色，此时谱图就属于激活状态

1.2.2色谱图处于激活状态后，在色谱图区域随意位置鼠标右键单击。在弹出的选框中选择Ranges。

1.2.3添加样本信息，多个样本可在“1”处多次添加。弹出下面弹框，图中参数说明如下：

选择展示的数据个数：目前可支持8个通道（8个样本）数据同时展示，勾选几个方框同时展示几个数据的离子流图。 *注：如果想展示多个通道的数据，在File处需要分别导入多个样本的原始数据；

“1.”中选择一个通道后，在“2”中设置需要展示该通道上的rawdata；

利用ms/ms2的质谱图来绘制上图的离子流图；

谱图显示方式，可以选择TIC/BPC图；

每勾选一个通道后需要设置此处状态为“MS”状态。

设置完成之后，点击确定即可。

1.2.4红框表示样本信息，不同颜色对应不同样本的TIC图。键盘中选择“Ctrl+p”，选择pdf格式，将图形打印至本地。

1.2.5如果想把几张TIC图合并成一张图形，即多张离子流图叠加。同样是在色谱图区域任意位置单击鼠标右键，选择“display options”。

1.3 谱图保存

在弹出的选框中进行如下参数的设置，并点击“确认”按钮。叠加后的图形也可使用“Ctrl+P”保存至本地。

1.4 BPC图提取

如果想提取样本BPC图，Plot type参数选择“Base Peak”参数，此时Range(s)处于可调整状态，输入想要时间点即可。

以上是TIC图、BPC图等色谱图的调取过程，也有些文章会展示代谢物的二级质谱图。接下来就是代谢物二级质谱图的调取教程。

# 调取代谢物二级质谱图#

代谢物二级质谱图提取其实和TIC图提取类似，在“图钉”激活时选择下方质谱图区域的“图钉”，使之处于可调整状态。之后根据目标代谢物的分子量、色谱保留时间提取目标代谢物的二级谱图。

具体操作如下：

2.1 确定目标代谢物的检测模式、分子量（m/z）、色谱保留时间（RT）

既然有目标物质，首先需要在特定检测模式（pos，neg）代谢物定性定量表中确定目标代谢物的分子量，根据分子量的数值，选择合适的SQC样本（SQC是指QC样本的分子量扫描范围。本示例中SQC1的扫描范围是70-200，SQ2扫描范围是190-400。这些信息可以在质谱图中查看到。SQC样本检测模式需与目标代谢物的检测模式一致）。

2.2 在SQC样本中查找目标代谢物m/z、RT信息

选择合适的SQC样本，软件打开该文件的原始数据，使色谱图部分处于激活状态。

在任意区域鼠标右键单击。再出现的弹框中选择“Range(s)”（操作方式同TIC图的提取）。在“Filter”中选择目标代谢物的分子量，并点击确定。若没有找到目标代谢物可以选择与目标代谢物分子量十分接近的物质，再点击确定。

Plot type参数选择TIC。

2.3 质谱图中获取代谢物的二级谱图

接下来就需要结合目标代谢物的RT信息，在质谱图中找到这个物质。软件中RT的单位是分钟，如果大家定性定量表中RT的单位是秒，则需要换算成分钟才可以。本例中，目标代谢物的RT值为587.8535s，换算之后为9.79min。激活质谱图，并在色谱图中点击这个时间点，对应质谱区域即可出现该物质的二级谱图。

代谢物的EIC图

代谢物的二级谱图

“Ctrl+p”选择保存模式和位置，之后即可在其他软件中添加物质结构信息或其他的个性化调整。

二级谱图参数介绍：

1.代谢物在色谱中的保留时间；

2.代谢物分子量信息

3.质谱扫描范围

如果原始文件中没有SQC文件，可以在样本中的原始文件中查找该物质。

以上就是代谢物TIC图、BPC图、二级质谱图的提取了，是不是很简单！操作起来不难的，大家完全可以get这项技能，随时随地提取谱图信息，而且还不受网速的影响。快点学起来~

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参考文献

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[1] Zhou Y, Wu S, Wang F, et al. Assessing the toxicity in vitro of degradation products from deoxynivalenol photocatalytic degradation by using upconversion nanoparticles@TiO2 composite. Chemosphere. 2020 Jan;238:124648.

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