DNA定点突变实验方法原理及步骤详解

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DNA定点突变实验方法原理及步骤详解

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1. 引物和质粒都准备好后,当然就是做PCR喽,不过对于PCR的酶和buffer,不能用平时的,我们做PCR把整个质粒扩出来,延伸长度达到几个K,所以要用那些GC buffer或扩增长片段的buffer,另外,要用保真性能较好的PFU酶来扩增,防止引进新的突变。

2. Quick change试剂盒分为几种不同的类型,QuikChange®、Site-Directed Mutagenesis Kit标准点突变试剂盒 、QuikChange®、 XL Site-Directed Mutagenesis Kit长模板单点突变试剂盒(>8kb)从原理上是一样的,只是PCR的酶和BUFFER不一样,后面用了比较适合长片段扩增的酶和BUFFER罢了,没什么特别的东西。

3. DpnI处理的时间最好长一点,最少一个小时吧,最好能有两三个小时,因为如果模板处理得不干净,哪怕只有那么一点点,模板直接在平板上长出来,就会导致实验失败。

4. 实验板长出来的菌有两种可能,一种是质粒DPNI没处理干净长出来的(模板),一种是PCR产物转化出来的(突变体),不过这两种菌长得一模一样,即使提出质粒来也是一样(酶切和PCR都无法区分),除了测序,是分不出来的。

5. 做PCR时也最好做一个负对照(不加引物),实验管由于PCR时有引物,所以在DNPI处理前里面既含有模板又含有PCR产物,而对照管由于PCR时没放引物,所以在DPNI处理前里面只有模板。如果两者都拿去DNPI处理,就能够证明模板已经被去除干净。若实验顺利的话应该是:正对照长菌负对照不长菌。如果出现正负对照都长菌,那么就是DpnI没处理好,如果正负对照都不长菌,那么有两种可能,一种是PCR阴性,也就是说PCR出问题了,另外一个可能就是转化出问题了。要搞清楚是哪个问题,跑胶说明不了问题,那就做个转化的对照,拿试剂盒的对照实验去试感受态,马上就能知道转化有没问题。返回搜狐,查看更多



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