跟着Nature学作图:R语言ggplot2环形堆积柱形图完整示例 |
您所在的位置：网站首页 › 论文中的柱状图怎么做 › 跟着Nature学作图:R语言ggplot2环形堆积柱形图完整示例 |
跟着Nature学作图:R语言ggplot2环形堆积柱形图完整示例
|
论文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of tetrapods https://www.nature.com/articles/s41586-022-04664-7#Sec33 数据代码链接https://github.com/j-marin/Global-reptile-assessment- 今天的推文学习一下推文中的Figure 1b的环形堆积柱形图，没有找到论文中的作图代码，但是找到了原始数据集，有了原始数据集就可以自己写代码来做这个图  image.png 代码可以参考这个链接 https://r-graph-gallery.com/297-circular-barplot-with-groups.html 部分示例数据截图 image.png 每个组之间的空白应该是通过缺失值实现的 读取数据 代码语言：javascript复制library(readxl) dat01% mutate(new_x = rep(paste0('X',formatC(1:31,width = 2,flag = 0)),each=8)) -> dat01 最基本的堆积柱形图 代码语言：javascript复制library(ggplot2) ggplot(data = dat01,aes(x=new_x,y=n,fill=rlCodes))+ geom_bar(stat = "identity",position = "fill") image.png 这里有一个问题是论文中的图第一个柱子不是1,暂时没有想明白是什么意思 这里有点看起来是分组堆积柱形图的效果，ggplot2好像没有做分组堆积柱形图的函数，他这里的处理方式是增加x，并给新增加的x赋值为零 变成环状 代码语言：javascript复制ggplot(data = dat01,aes(x=new_x,y=n,fill=rlCodes))+ geom_bar(stat = "identity",position = "fill")+ coord_polar()+ ylim(-1,NA) image.png 接下来是修改细节 代码语言：javascript复制ggplot(data = dat01,aes(x=new_x,y=n,fill=rlCodes))+ geom_bar(stat = "identity",position = "fill")+ coord_polar()+ scale_x_discrete(expand = expansion(add = 0), labels=coalesce(dat01$orderName[seq(1,248,8)],""))+ scale_y_continuous(limits = c(-1,NA))+ theme(axis.text.x = element_text(angle = cumsum(c(90,-rep(12,15))), vjust=0,hjust = 1), panel.background = element_blank(), axis.text.y = element_blank(), axis.title = element_blank(), axis.ticks = element_blank())-> p1 p1 image.png 代码语言：javascript复制p1 + annotate(geom = "text",x=2,y=-0.1,label="Birds",angle=-15)+ annotate(geom = "text",x=8,y=-0.1,label="Amphibians",angle=-90)+ annotate(geom = "text",x=14,y=-0.1,label="Mammals",angle=15)+ annotate(geom = "text",x=24,y=-0.1,label="Reptiles",angle=90)+ scale_fill_manual(values = c("LC"="#98d09d","NT"="#d7e698", "DD"="#dadada","VU"="#fbf398", "EN"="#f7a895","CR"="#e77381", "EW"="#9b8191","EX"="#8f888b"), limits=c("EX","EW","CR","EN","VU","DD","NT","LC"), name="") -> p2 p2 image.png 构造新的数据集用来添加坐标轴 代码语言：javascript复制new_dat01 |
【本文地址】
今日新闻 |
推荐新闻 |