一种应用STING蛋白亲合纯化环二核苷酸的方法

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一种应用STING蛋白亲合纯化环二核苷酸的方法

2023-01-31 09:54| 来源: 网络整理| 查看: 265

申请/专利权人:山东大学

申请日:2019-09-10

公开(公告)日:2022-10-28

公开(公告)号:CN110590888B

主分类号:C07H19/213

分类号:C07H19/213;C07H1/06;C07H21/02;B01D15/38

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2022.10.28#授权;2020.01.14#实质审查的生效;2019.12.20#公开

摘要:本发明公开了一种应用STING蛋白亲合纯化环二核苷酸的方法,属于微生物发酵提纯的技术领域。本发明是利用了镍螯合琼脂糖为固相载体,与C端带有组氨酸标签His‑tag的人源干扰素基因刺激蛋白的配体结合结构域STINGLBD,residues149‑341相结合后,填入柱子中制成STING亲合柱。该亲合柱能够和环二核苷酸特异性结合,然后可通过含尿素溶液对所结合的配体进行专一的洗脱。本发明的有益效果为:1、解决了现有技术无法从复杂样品中直接提取环二核苷酸的难题;2、只需经过一步纯化即可从复杂样品中获得纯度>80%的环二核苷酸;3、大大的降低了环二核苷酸的制备成本。

主权项:1.一种应用STING蛋白亲合纯化环二核苷酸的方法,其特征在于,所述方法是利用STING亲和柱从复杂样品中分离环二核苷酸,所述STING亲和柱的固相载体是快流速型镍螯合琼脂糖;具体的操作步骤如下:(1)将人源干扰素基因刺激蛋白STING149-341位的配体结构域STINGLBD所对应的基因通过PCR扩增并构建到pet30a载体上,所用酶切位点是NdeI和XhoI,产生一个C端Histag;(2)将重组质粒pet30a-STINGLBD转入E.coliBL21DE3中,并转移到含有50ugml卡那抗生素的固体LB培养板上,然后置于37℃过夜培养,出现菌落;(3)挑单克隆接种到含有50ugml卡那抗生素的液体LB,37℃振荡培养过夜;取过夜培养菌1:100接种到含有50ugml卡那抗生素的LB液体培养基,37℃振荡培养至OD600到0.7~0.8,加入终浓度为0.1mmolL的IPTG,18℃诱导16h;(4)收菌,低温4℃离心,离心参数:转速3500rpm,时间30min;(5)快流速型镍螯合琼脂糖预处理,取50ml未加载的快流速型金属离子螯合琼脂糖装在长25cm,内径为2.2cm玻璃柱子里,先用300ml双蒸水冲洗,后用200ml50mmolLEDTA冲洗柱子,接着用双蒸水冲洗,再用1mmolLNaOH浸泡半小时;接着用双蒸水冲洗柱子至中性,加入0.1mmolLNiSO4,使Ni2+离子结合到基质上,再用双蒸水冲洗掉多余的Ni2+离子,制成镍螯合琼脂糖柱子;其中,未加载的快流速型金属离子螯合琼脂糖为IMAC琼脂糖,产品型号为cat.no.17057502,生产厂家为GEHealthcare;(6)制备STING亲合柱;用重悬缓冲液平衡镍螯合琼脂糖柱子后,将步骤(4)所得上清样品,加入螯合琼脂糖柱子,使STINGLBD蛋白被镍螯合琼脂糖结合,然后用漂洗缓冲液冲洗柱子,再用1L重悬缓冲液冲洗柱子,接着用500ml2mmolL尿素冲洗柱子,最后再用500ml的重悬缓冲液冲洗柱子并存放在重悬缓冲液中,存放于4-10℃中待用;其中,漂洗缓冲液为20mmolLTris-HCl,pH=8.0,200mmolLNaCl水溶液,20mmoL咪唑水溶液;重悬缓冲液为20mmolLTris-HCl,pH=8.0,200mmolLNaCl水溶液;或,使用nhs活化琼脂糖凝胶或cnbr活化琼脂糖凝胶代替快流速型镍螯合琼脂糖作为STING亲和柱的固相载体;(7)取通过微生物发酵法所得的含有高浓度环二核苷酸的大肠杆菌菌体,加入重悬缓冲液重悬菌体,高压破碎后,低温4℃离心,离心参数:12000g,60min;(8)取上清液,沸水浴15min,待冷却后,再次低温4℃离心,离心参数:12000g,60min;取上清液,用0.22~0.45μm的滤膜过滤,然后加入2倍体积的重悬缓冲液稀释样品,将样品加入已平衡好的STING亲合柱,流穿样品也被收集保留;上样结束后,用300mmolL的醋酸钠冲洗柱子,流穿样品也被收集保留;待冲洗结束后,用0.1~1.5mmolL尿素溶液洗脱环二核苷酸,直至核酸浓度小于5ngul,时停止收集洗脱液,核酸浓度用K5600微量分光光度计检测;将前面所得流穿样品合并加入STING亲合柱,再次进行冲洗和洗脱纯化环二核苷酸;样品的产率达90%,HPLC液相紫外图谱显示已没有明显的杂峰,纯度80%;(9)洗脱结束后,用2molL尿素冲洗重生柱子,再用重悬缓冲液大量冲洗平衡柱子,存放于4~10℃中待下次使用。

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