图1.分析创伤性脑损伤 （TBI） 中受替勃龙代谢物分子调节的生物过程。

TBI病理学的雌激素调节机制

关于α-β-tibo/TBI的共享基因，前10个富集项（图2A）包括电压门控钙通道活性的负调控，胞质钙离子浓度的负调控，单萜类代谢过程，对可卡因的反应，对吗啡的反应，对生物碱的反应，磷脂酶C激活的多巴胺受体信号通路，脉冲前抑制，调节参与突触传递的多巴胺摄取和儿茶酚胺的调节参与突触传递的摄取。ShinyGO分析的结果（图2B）验证了跨突触信号转导为最富集项，KEGG富集分析也获得了类似的发现（图2C）。

图2.创伤性脑损伤 （TBI） 中 α-tibo 和 β-tibo 调节细胞功能的机制。

TBI 病理学的雄激素和孕激素调节

对TBI 中 Δ-tibo 调节的 661 个生物过程，分析得到前十的关键生物学过程（图3A）。为了证实上述结果，ShinyGO的富集描述了前10个生物富集术语中的炎症反应和细胞因子介导的信号通路（图3B）。同样，根据KEGG的结果，IL-17信号通路是富集最多的类别，除了TNF信号通路（图3C）。

图3.TBI 中 Δ-tibo 的雄激素和孕激素调节。

TBI 的综合效应

生物过程的GO富集前10个类别，其中包括线粒体去极化的正调控等。使用 Metascape，四个共享列表中的丰富术语主要描述了类固醇信号传导和代谢过程，特别是替勃龙代谢物如何调节与细胞生长、凋亡、发育和细胞代谢相关的不同细胞过程（图4B）。为了理解这些术语之间的关系，生成了它们的子集，并以网络的形式显示（图 4C）。

图4.TBI中替勃龙的α、β或Δ代谢物对生物过程的调节。

ATBC与5个核心靶基因的分子对接

基于16种共享蛋白的相互作用网络（图5 A），MCODE分析显示，PPARA在维持网络内的稳态中起着关键作用（图5 B)。对该亚簇进行的生物学过程和分子功能的进一步分析表明，DNA 转录以及类固醇和脂质信号转导富集（图 5C–D），其细胞区室出现在染色质、染色体和线粒体中（图 5E）。

最后，使用Cytohubba，确定图5A中所示的基因出现在前10个参数中的次数（图6A）。这些结果表明，KDR、ESR2、AR、NR3C1、PPARD和PPARA是网络中最重要的基因。为了证实这一点，作者对这些不同参数进行了相关性分析。如图6B 所示，发现介数与度数关系的决定系数较低。然而，在预测程度和接近度之间的交互作用时，R2值为 0.8161（图6C）。同样，图6D 显示了度数和 DMNC与R之间的弱相关性值为 0.3821，而度数和 MCC 之间的相关性更强，R2值为 0.7775，如图 6E 所示。

图5.TBI 和替勃龙代谢物之间共同基因的相互作用网络。

图6.TBI 和替勃龙代谢物之间共有的16个基因网络的不同拓扑参数之间的相关性。

标题：Network pharmacology and topological analysis on tibolone metabolites and their molecular mechanisms in traumatic brain injury

译名：替勃龙代谢物在创伤性脑损伤中的网络药理学和拓扑学分析及其分子机制

期刊：Biomed Pharmacother

影响因子：7.5

发表时间：2023.7.6

作者：George E Barreto，利默里克大学生物科学系返回搜狐，查看更多