【网络药理学】二、疾病靶点筛选

您所在的位置:网站首页 药理学no是什么意思 【网络药理学】二、疾病靶点筛选

【网络药理学】二、疾病靶点筛选

2024-04-19 08:36| 来源: 网络整理| 查看: 265

二、疾病靶点筛选1.主要常用数据库

(1)GeneCards(https://www.genecards.org/)注:需注册登录。

①搜索所需查找的疾病。(例:PCOS)

②点击“Export”项目下的“Export to Excel”,导出EXCEL文件。

③打开下载好的文件,将第一列“Gene Symbol”项目下的靶点复制到EXCEL备用。

(2)DisGeNET(https://www.disgenet.org/search)注:需注册登录。

①输入疾病名称,点击下方出现的疾病。

②点击搜索。

③点击“Summary of Gene-Disease Associations”。

④点击Download,导出EXCEL文件。

⑤打开EXCEL文件,筛选出“Score_gda”0.1以上的靶点,将“Gene”项下的靶点复制到EXCEL备用。

(3)OMIM(https://omim.org/)

①点击“Gene Map”。

②输入疾病名称,点击搜索。

③点击“Download AS”项目下的“Excel File”。

④打开下载好的EXCEL文件,将“Gene/Locus”项下的靶点复制到EXCEL中。

⑤选中所有数据,点击“数据”→“分列”。

⑥点击“下一步”,勾选“逗号”,点击“下一步”,点击“完成”。

⑦每一列分别升序排列,选择“以当前选定区域排序”,点击“排序”。

⑧每一列分别选中,点击“数据”→“删除重复值”,选择“以当前选定区域排序”,点击“删除重复项”,点击“确定”。

⑨通过“查找和替换”将空格删除。

⑩将所有数据合并到一列,并按上述方法删除重复项,复制到EXCEL备用。

(3)Pharmgkb(https://www.pharmgkb.org/)

①输入疾病名称并搜索。

②勾选左侧Gene。

③右键基因名称,点击“在新标签页中打开链接”。

④复制基因名,粘贴到EXCEL中备用,其他基因同上。

2.其他数据库

(1)Drugbank(https://go.drugbank.com/)

(2)TTD(https://db.idrblab.net/ttd/)

(3)GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)



【本文地址】


今日新闻


推荐新闻


CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3