2022年2月4日，NEW PHYTOLOGIST在线发表了上海交通大学生命科学技术学院/代谢与发育科学国际合作联合实验室袁政教授课题组题为“A rice single cell transcriptomic atlas defines the developmental trajectories of rice floret and inflorescence meristems”的研究论文。研究人员利用单细胞测序系统绘制了水稻花序早期发育的动态全景图，重建了水稻小穗、花和各类生殖分生组织的发育轨迹。通过分子和遗传分析，明确WOX转录因子DWT1在调节水稻花分生组织活性中发挥功能；证明了生长素转运蛋白OsAUX1在花序发育中的作用，为生长素调控水稻花序分枝提供了直接的遗传证据。上海交通大学生命科学技术学院博士生宗杰、王丽、朱璐为并列第一作者，袁政教授为通讯作者。上海交通大学张大兵教授，梁婉琪教授、上海市农业科学院作物育种栽培研究所曹黎明研究员、马普研究所George Coupland院士等参与了本项研究的实施。

水稻是人类重要的粮食作物之一，在我国粮食生产中占有重要的地位。水稻花序的形态结构是直接决定最终产量的重要农艺性状之一。水稻花序发育和形态建成包括花序分生组织（IM）、一次和高次枝梗分生组织（BMs），小穗分生组织（SpM）以及花分生组织（FM）等多类生殖分生组织活性的调节、属性转换，以及花器官属性建立和形态建成等发育事件，受外在环境条件和内在遗传因子等多方面因素调控。但人们对IM、BMs、SpM和FM之间的形态和分子差异，以及它们在发育中的细胞水平差异仍不甚了解。近年来，多家实验室使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究了拟南芥、玉米、水稻等材料根、茎和叶等组织的细胞特性和异质性，不仅在单细胞分辨率上提供了有价值的转录组学信息，还对这些器官的发育轨迹提供了前所未有的见解，也为开展植物花序和花器官的发育轨迹分析提供了新的契机。

该研究以2个含盖水稻花序早期发育各生殖分生组织转换、花器官属性建立等发育过程的样本S1（花序长度