在临床上，舌根一侧疼的原因很多，可能是由于牙齿问题、舌黏膜溃疡、扁桃体发炎、舌炎、灼口综合征等导致，此时需要针对情况进行具体分析。

1、牙齿问题：可能是由于磨牙的牙齿有尖锐牙尖，或者不良修复体，总是刺激舌根、摩擦舌根，导致疼痛，这时需要前往口腔科将牙尖打磨光滑，减少对舌根的刺激；

2、舌黏膜溃疡：如果舌根一侧由于辛辣食物刺激出现溃疡时，会存在明显创口，而在溃疡创口溃烂后可能会导致神经末梢与外界接触，进而对创口产生一定刺激，则可能会造成舌根疼；

3、扁桃体发炎：可能是由于受凉、劳累等原因导致扁桃体发炎，而由于扁桃体与舌根部距离较近，因此当扁桃体发炎时可能会导致舌根出现疼痛；

4、舌炎：可能是由于细菌感染、外伤、舌部黏膜溃疡等原因造成舌乳头发炎，也有可能会表现为一侧舌根疼的情况；

5、灼口综合征：可能是由于长期喝酒、吸烟、进食辛辣刺激性食物，或过度刷牙所导致，通常以舌部为发病部位。这时可应用神经营养的药物，注意休息，补充复合维生素。

除上述原因外，还有可能是茎突过长、慢性咽炎、舌咽神经痛、舌肿瘤等导致，这时可以应用消炎药或者请专业医生进行诊断。如果是舌体黏膜溃疡所导致，需要注意饮食清淡，多喝水，同时需注意口腔卫生，可以使用呋喃西林溶液漱口，也可以使用西地碘含片，能够促进溃疡愈合。