数据太大爆内存怎么办?七条解决思路 |
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Jason Brownlee 在研究、应用机器学习算法的经历中,相信大伙儿经常遇到数据集太大、内存不够用的情况。 这引出一系列问题: 怎么加载十几、几十 GB 的数据文件?运行数据集的时候算法崩溃了,怎么办?怎么处理内存不足导致的错误?本文将讨论一些常用的解决办法,供大家参考。 处理大型 ML 数据文件的七种思路1. 分配更多内存有的机器学习工具/库有默认内存设置,比如 Weka。这便是一个限制因素。 你需要检查一下:是否能重新设置该工具/库,分配更多内存。 对于 Weka,你可以在打开应用时,把内存当作一个参数进行调整。 2. 用更小的样本你真的需要用到全部数据吗? 可以采集一个数据的随机样本,比如前 1,000 或 100,000 行。在全部数据上训练最终模型之前(使用渐进式的数据加载技巧),先试着用这个小样本解决问题。 总的来说,对算法做快速地抽查、看到结果在前后的变化,在机器学习领域是一个很好的习惯。 你还可以考虑:相对于模型技巧,做一个数据大小的敏感性分析。或许,对于你的随机小样本,有一个天然的边际效应递减分水岭。越过这个关口,继续增加的数据规模带来的好处微乎其微。 3. 更多内存你必须要用 PC 吗? 你可以考虑内存、性能高一个量级的计算设备。比如,租用 AWS 这样的云服务。租用云端有数十 GB 内存的机器,最低价格每小时不到一美元。我个人觉得这是非常实际的选择。 4. 转换数据格式你是否把数据存为原始的 ASCII 文本,比如 CSV 文件? 或许,使用其它格式能加速数据载入并且降低内存占用。好的选择包括像 GRIB、NetCDF、HDF 这样的二进制格式。 有很多命令行工具能帮你转换数据格式,而且不需要把整个数据集载入内存里。 换一种格式,可能帮助你以更紧凑的形式存储数据,节省内存空间;比如 2-byte 整数,或者 4-byte 浮点。 5. 流式处理数据,或渐进式的数据加载你的所有数据,需要同时出现在内存里吗? 或许,你可以用代码或库,随时把需要的数据做流式处理或渐进式加载,导入内存里训练模型。 这可能需要算法使用优化技术迭代学习,比如使用随机梯度下降。那些需要内存里有所有数据、以进行矩阵运算的算法,比如某些对线性回归和逻辑回归的实现,就不适用了。 比如,Keras 深度学习 API 就提供了渐进式加载图像文件的功能,名为 flow_from_directory 另一个例子式 Pandas 库,可批量载入大型 CSV 文件。 6. 使用关系数据库(Relational database)关系数据库为存储、访问大型数据集提供了标准化的方法。 在内部,数据存在硬盘中,能渐进式地 in batch 批量加载,并使用标准检索语言 SQL 检索。 像 MySQL、Postgres 这样的开源数据库工具,支持绝大多数的(全部?)编程语言。许多机器学习工具,都能直接与关系数据库连通。你也可以用 SQLite 这样更轻量的方法。 我发现,这种方法对大型表格式数据集非常有效率。 再次提醒,你需要用能迭代学习的算法。 7. 使用大数据平台有的情况下,你可能必须要使用大数据平台,即为处理超大型数据集而开发的平台。它们能让你进行数据转换,并在其上开发机器学习算法。 两个很好的例子是 Hadoop 与机器学习库 Mahout,以及 Spark 与 MLLib 库。 我认为,这是用尽上述办法仍无法解决的情况下,才需要采用的最后手段。单纯是这为你的机器学习项目所带来的额外硬件、软件复杂情况,就会消耗许多精力。 即便如此,有的任务确实数据太过庞大,前面的选项都无法奏效。 |
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