有向无环图的了解

GO的本体被构造为图形，其中术语作为图形中的节点以及作为边缘的术语之间的关系（也称为对象属性）（Gene Ontology Overview中的更多本体信息）。正如定义每个GO术语一样，GO术语之间的关系也被分类和定义。本文档描述了GO中一些常用的关系：是（是子类型）; 的一部分 ; 有一部分; 调节，消极调节和积极调节。

所有术语（除了代表每个方面的根术语）都有一个与另一个术语的子类关系; 例如，

GO：1904659：葡萄糖转运 是（is a） GO：0015749：单糖转运。

基因本体采用了一些其他的关系，其中包括的一部分，例如，

GO：0031966：线粒体膜是部分（part of） GO：0005740：线粒体外膜

并规范，例如：

GO：0006916：抗凋亡 调节（regulate） GO：0012501：程序性细胞死亡

该集并非详尽无遗，仅包括GO本体，逻辑定义和注释中使用的关系子集。有关GO和其他本体中使用的关系及其属性的更多技术信息，请参阅OBO关系本体（RO）。

GO浏览工具（如AmiGO和QuickGO）广泛使用关系，并通过过度表示分析将相关的GO注释分组。例如，AmiGO页面上关于激酶活性的注释包括对“ fucokinase活性”，“ 蛋白激酶活性 ”等的注释。请注意，并非所有关系都可以安全地用于通过GO图对注释进行分组。请参阅下面的说明和示例，说明何时以及为何可以安全地通过关系对注释进行分组。

有许多方式可以引用和表示逻辑关系。GO关系文档使用以下约定（与基于图形的术语保持一致）：

该图解释如下：

在图表上方是由推断的形式数学/逻辑表示：ia a ∘ part of → part of

GO图中的节点可以与其他节点具有任何数量和类型的关系。与层次结构一样 - 例如，族树或物种的分类 - 节点可能与多个子节点（更具体）节点有连接，但与它们不同，它也可以具有多个父节点（更宽）节点，并且不同与不同父母的关系; 例如，节点可以具有与一个节点的关系的一部分，并且a是与另一个节点的关系。下图说明了这一点：

如果我们说A 是 B，我们意味着节点A是节点B的亚型/子类型

掌握这种关系，有助于得到相关联的分组注释。