共聚甲醛与均聚甲醛之间的主要区别在于不同聚合方法所形成的不同分子结构。

均聚甲醛是由一种单体聚合而成的规则晶体分子结构。 共聚甲醛是由两种不同单体共聚而成的更加无定形的结构。 

共聚甲醛 (POM-C) 和均聚甲醛 (POM-H) 均为半结晶塑料，但是 POM-H 的结晶度高于 POM-C。 

一般来说，POM-H 具有更好的机械性能，而 POM-C 则具有更好的耐化学性。 

均聚甲醛的硬度、刚度、抗拉强度和抗压强度要比共聚甲醛高出约 15%。此外，它在发生蠕变之前所能承受的载荷要比共聚缩醛高出约 10%。 

比起均聚甲醛，共聚甲醛的刚性略低，更易延展，但其中心线孔隙率明显更低。因此，与 POM-H 相比，POM-C 更不易发生渗气，可耐的化学品更广 (pH 4-13 vs. pH 4-9)。POM-C 的抗水解温度也高于 POM-H (85°C vs. 60°C)，且在空气中可耐受的连续使用温度更高 (100°C vs. 90°C)。