帝国想要扩张，就必须要向其他星球殖民（Colonization）。 游戏开始时，玩家的帝国只拥有一个母星（部分起源不止一个，但都在母星系内）。为了向外殖民，帝国需要建设殖民船并将其派到其他处于帝国控制下的宜居星球。 “宜居星球”与宜居度（见下）无关。宜居星球即使宜居度为0%依然可以进行殖民；而非宜居星球仍会显示0%宜居度，但彻底无法殖民。

宜居度受星球类型及修正，和物种的特质影响。宜居度对每个物种分别计算。越高越好。

只要宜居度低于100%，每1%差值+1%人口维护费与舒适度消耗、-0.5%人口增速及岗位产出（相加计算），直到0%时达到最大惩罚。

机械、机械体物种有200%的宜居度，这些物种几乎不用考虑宜居度的问题。

游戏中常见的宜居星球依气候分为3类，每类下再分3种。大多数非机械物种具有常规的宜居偏好：

在没有特殊的宜居偏好的情况下：

有些物种会有特殊的宜居偏好，通常是某些起源或事件的结果。

另有一些物种特质（如幸存者善于适应极易适应）会影响物种宜居度，但这些特质不属于宜居偏好。

还有一些星球修正可能影响单个星球的宜居度，如高重力低重力等。

星系视图中会在星系旁标记出其中的宜居或可环境改造星球。 标记数量代表星系内宜居且未被殖民的星球数量，但多于3个的时候仍只会显示3个标记。

标记颜色与星球宜居性有关，其代表的宜居性是帝国内所有可殖民物种当中，最宜居于该星球之物种的宜居性。

通常，面对宜居度较低的行星，可以有多种办法应对：

想要对一个不适合本种族居住的星球进行殖民，本质上有两个途径——对星球进行环境改造或者改变种族本身。环境改造只需要研究地表塑造技术，再投入大量能量币和时间即可。改变种族本身则有多种手段，最简单的方法就是直接换一个种族去殖民。

对于一个多种族帝国来说，当其原生种族不适合目标行星时，只需要派遣适合该行星的种族前去殖民即可。不过，如果是刚刚征服的种族的话，他们可能会在思潮和幸福度上存在减成，进而会降低星球的稳定度。

可以同某国建立起移民条约，这样无需征服其星球即可获得该种族的殖民船。（某些拥有特定性格的AI——一般都有排外/威权主义，会奴役外来人口，为了不让你的本族人受到奴役，最好是签了条约，建完殖民船就立刻中断。）

还可以在泛星系贸易市场购买奴隶。

需要注意的是，一颗星球是否稳定将很大程度取决于住房是否充足以及是否有较高的舒适度、犯罪的监管是否到位（较高的犯罪率将会触发令稳定度下降的事件）。而宜居度会影响舒适度的消耗，进而影响人口幸福度与稳定性；缺少住房也会影响稳定性。

在研究智能人科技并给予其殖民权力后便可利用适应所有环境的机械体进行殖民。但要注意的是机械人口需要相应的组装岗位产出才能增长。

研究完基因剪裁技术后即可对原生种族进行基因改造，可以添加提升宜居度的特质。

游戏内有4项宜居度科技，每一项+5%宜居度，还有死寂星球适应。

适应传统中的环境多样化+10%宜居度。

选择新殖民地主要看两点，行星的宜居度和大小。

到了游戏后期，对于整个帝国来说建立新的殖民地已经不是什么大事件，充足的资源和发达的技术可以轻易解决殖民地发展过程中遇到的困难。但是，游戏早期的殖民顺序仍然对后期游戏有重要影响，一般情况下应选择那些有较高宜居性的星球先行殖民，有利于帝国迅速成长。

另一个需要考虑的问题是星区的建立。星区的最大距离是4跳，一个良好的选址可以将更多行星纳入一个星区，减少总督的花费。

玩家可以通过行星决议来控制殖民地的具体概况（2.2之后版本）。从2.2版本开始，行星决议代替了行星法令（2.1版本）的出场。

殖民船是向外太空运送殖民人口的民用飞船。

想要进行外星殖民，首先需要在船坞建造一艘殖民船。殖民船的初始花费如下：

另有一些特殊的殖民船花费：

建造耗时1年。开始建造时，必须选定前往殖民的物种，殖民物种必须是物种权利可殖民的物种（包括机器人）。

殖民船造好后，每个月需要1能量币维护。殖民船没有任何防御能力，不要将它们派往敌对或不安全的区域。较为稳妥的方式是在已知安全或探测过的行星系开拓新殖民地，或者安排战舰护航。

选择殖民船，右键点击目标行星，选择进行殖民即可。殖民船抵达新世界后，会进入行星轨道并在着陆点着陆，花费一定时间进行殖民地初始化准备。这个过程中殖民地不会有任何产出，且仍然需要每月能量币来维护。

该时间受人口增长曲线影响，在游戏开始时约为3年。随着科学技术或社会学研究的提升，初始化所需时间会被缩短：

初始化完成后，星球上会有舰船改装庇护所作为新殖民地的临时据点。随着人口增长，该建筑可升级为行星首府，并依人口继续增长和科技进步可进一步增长。

如星球以前曾被殖民过（所有的人口被迁出或净化，星球被中子灭杀或天洪浩荡等），任何以前遗留的建筑和区划也将保留。部分玩家不可用的建筑将被替换为相应的可用版本。

殖民地建立完成后，星球会获得1人口（受下列加成），并且开始人口增长进程。

这时，帝国可以着手建设新建筑、清除地块障碍、向新殖民地迁移人口等。

帝国可以给殖民地所属的星域指派总督，总督的特性会给殖民地带来不同影响。