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2023-03-24 23:46| 来源: 网络整理| 查看: 265

在《WB样品准备》中笔者提到了WB样本(细胞或组织)、蛋白变性及蛋白保存的相关要点。在此,笔者简要介绍蛋白的提取与蛋白定量。

一、蛋白提取

1、蛋白裂解液与裂解环境

现如今,商业化的蛋白裂解有很多中,有强效的、裂解时间短(约5-10min);也有普通的、裂解时间尚可(约30min);也有超强效的,裂解时间极短(小于5min)。其中,上述裂解液的裂解环境,一般推荐为冰上或者4℃裂解,减少蛋白降解;而在蛋白裂解液中也推荐加用磷酸酶抑制剂和蛋白酶抑制剂,抑制细胞内酶对蛋白的自然降解。

对于普通蛋白的提取,如实验时间无特殊,选用普通的蛋白裂解液、冰上裂解即可;对于极易受环境影响的蛋白(比如低氧相关蛋白,HIF-1等),研究报道将细胞从低氧培养箱中取出2-3min即可影响HIF-1表达,因此宜选用超强效蛋白裂解液,并在低氧培养箱(37℃)中快速裂解。

2、组织蛋白提取

在组织蛋白提取过程中,一般推荐加用蛋白裂解液(磷酸酶和蛋白酶抑制剂)后,冰上研磨、匀浆化处理组织。组织来源不同,蛋白的产出亦不相同。欢迎各位留言,分享经验,比如1mg组织能产出多少蛋白。

二、蛋白定量

1、蛋白浓度测定

蛋白定量的方法有很多种,应用较多的主要有两种:BCA蛋白定量检测法和Bradford蛋白定量检测法,市售的蛋白定量试剂盒也多基于上述两种检测方法而开发的。两种方法均需配制蛋白标准品,蛋白与定量试剂经过一定时间的反应(BCA法反应为37℃、20-30min,Bradford法反应一般为37℃,5min),酶标仪读取样品的OD值,绘制的蛋白标准曲线,依据标准曲线计算WB蛋白的浓度。两种检测方法笔者均有使用经验,相比BCA法,Bradford法不仅节省反应时间,也无需配置反应试剂,简单、快速、好用,笔者推荐Bradford法测定蛋白浓度。

严格来说,每次的蛋白浓度测定均需配制新鲜蛋白标准品,保证每次测到的蛋白浓度的准确性。然而,WB法评估蛋白表达水平本身就是一种半定量或者相对定量,因此在实际蛋白样本准本及浓度测定时只需保证均一性即可,即使用同样的标准曲线计算同一批蛋白的浓度,如果计算准备即可保证蛋白上样时内参水平基本一致。因此,在实际操作中我们只需测定一次标准品的OD值、绘制标准曲线,即可用此曲线来计算后续实验蛋白的浓度,节省时间和试剂。

具体的蛋白定量步骤,各位朋友参考试剂盒提供的方法即可,简单易行。至于标准曲线的绘制,网络亦可查到不是帖子介绍用不同软件绘制标准曲线,笔者在此不做详细介绍,。如有需要,可本帖留言。

2、蛋白浓度的调平

有研究者喜欢计算添加loading buffer及变性以后的蛋白终浓度和上样体积,然后在蛋白上样时用loading buffer配平,保证上样体积基本一致。而笔者更喜欢用loading buffer和蛋白裂解液调整蛋白浓度到基本一致(一般为1-2ug/ul)以后再变性,如此蛋白上样时只需使用相同体积的蛋白样品即可,笔者经验是这样的方法相对省时且不容易出错。



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