生物与环境之间的相互影响，是地球上的生命出现以来就普遍存在的一种自然现象。生态学自1866年诞生以来，人们对其探索不断深入。人类对生态规律性的认识逐渐由浅入深、由片面到全面，有力地推动生态学取得了长足发展。尽管如此，由于传统的生态研究视野局限在宏观水平上，导致得某些外貌或形态相同的生命有机体，由于所处环境条件的不同，其生理功能不同；而亲代外貌、形态和生理功能相同的生命有机体，子代却由于所处的环境条件不同而产生新的变异。因此，要想深入探索宏观生态现象及其与环境互作效应的多样性，需结合微观的室内实验分析来揭示其本质。这使得分子生态学迅速发展成为当前国际生态学研究的热点和新的增长点。由于是多学科交叉的产物，分子生态学囊括了种群遗传学、保护遗传学、污染生态学、微生物生态学、行为生态学、亲缘地理学及生态毒理学等多个主体内容，课程涵盖的信息量广泛且深入。

    《分子生态学》是介绍生物活性分子在其显示与生命关联的活动中所牵连到的分子环境问题，它是分子生物学与生态学融合而成的新的生物学分枝学科，不只是应用分子生物学技术研究生态学问题。本课程从分子生态学研究的历史开始，概括了分子生态学的自然史、遗传学、基因与蛋白质、种群、微生物与进化之间的关系，进而介绍了分子生物学在种群遗传学、保护遗传学、微生物生态学、行为生态学、亲缘地理学、生态毒理学及相关领域的应用，重点讨论了分子生态学在环境污染与修复领域的相关研究。