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2024-07-11 04:30| 来源: 网络整理| 查看: 265

G-四链体二聚体:一种高效增强硫黄素T荧光的核酸结构

硫黄素T(ThT)分子由一个苄胺环和一个苯硫醚环组成,这两个环可以围绕C-C键自由旋转,导致ThT的荧光很低。当这种旋转受到某些特殊结构的限制时,ThT的荧光就会被增强。近年来,研究发现ThT能够特异性结合G-四链体(G4),使其荧光得以增强。基于此荧光现象,G4/ThT被广泛地用作荧光指示剂构建非标记型生物传感,实现了对多种分析物的检测。但是,相比其他的荧光探针,G4/ThT体系荧光发射强度较弱且易受到介质中一价阳离子浓度的影响,在应用于复杂样品中低浓度物质定量检测时具有一定的局限性。

最近,陕西师范大学李保新教授(点击查看介绍)课题组发现G-四链体二聚体对ThT荧光的增强作用远大于G-四链体单体。PW17是一个常用于形成G4单体的核酸序列,两个串联PW17序列可直接折叠成稳定的G4二聚体,此G4二聚体/ThT的荧光强度约为相应的G4单体/ThT的9倍(如图1所示)。此外,与常规的G4单体/ThT相比,G4二聚体/ThT体系在不同浓度的Na+-K+的介质呈现出更稳定的荧光发射。利用圆二色光谱(CD)、核磁等手段较详细地研究G4二聚体与ThT的相互作用,探讨了G4二聚体高效增强ThT荧光的机制。

图1. G4二聚体增强ThT荧光的示意图

在此基础上,以G4二聚体/ThT为荧光指示剂,构建了一种无标记DNA弓形探针。此外,通过在扩增产物中嵌入一个G4二聚体序列,设计了一种基于滚环扩增(RCA)的生物传感策略(如图2所示),来展示G4二聚体/ThT荧光指示剂的分析性能。在优化的实验条件下,该传感体系对p53基因检测的线性范围为0.01 ~10 fM,检出限为10 aM,此检出限远低于相同条件下以G4单体/ThT为荧光指示剂的RCA传感策略。此生物传感体系灵敏高的原因归于二个因素:(1)G4二聚体/ThT具有高的荧光发射;(2)在G4二聚体中,两个G4序列之间没有额外的连接序列,提高了RCA产物碱基的利用率。

图2. (A)G4二聚体-RCA生物传感策略检测p53基因的示意图;(B)在不同实验条件下,体系的荧光强度;(C)G4二聚体-RCA生物传感体系的线性相应;(D)G4单体-RCA生物传感体系的线性相应。

这项研究表明,G4二聚体对ThT有很强的亲和力,能够高效地增强ThT的荧光发射。本研究为基于G4/ThT的高灵敏且稳定的无标记荧光生物传感的构建提供了一种新策略,具有良好的应用前景。

该工作发表在分析化学领域的权威期刊Analytical Chemistry 上,硕士生景少春是该工作的第一作者,通讯作者是李保新教授。研究工作得到了国家自然科学基金面上项目(21775099)的支持。

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Dimeric G-Quadruplex: An Effective Nucleic Acid Scaffold for Lighting Up Thioflavin T

Shaochun Jing, Qiang Liu, Yan Jin, Baoxin Li*

Anal. Chem., 2020, DOI: 10.1021/acs.analchem.0c02637

李保新教授简介

1995年7月在陕西师范大学化学系,获理学学士学位;1995-1998年就读陕西师范大学化学系,获分析化学专业理学硕士学位;1999-2002年就读西南大学化学与化工学院,获分析化学专业理学博士学位;2004年-2005年在英国Cardiff大学化学系做高级访问学者研究。2003年晋升为教授,2004年入选首批教育部新世纪优秀人才资助计划。

长期从事分析化学方面的教学和科研工作,研究工作主要集中在发光分析及生物传感。迄今为止,主持国家自然科学基金项目6项,教育部基金重点项目1项和陕西省重点科研项目1项。2002年获霍英东教育基金会第八界高等院校青年教师基金资助。研究成果获陕西省科学技术奖一等奖1项、二等奖2项,其博士论文获“全国百篇优秀博士论文提名奖(2004年)”。相关研究成果发表在Chemistry-A European Journal、Analytical Chemistry、Chemical Communications等期刊。所发表的论文已被他引3800多次,其中有9篇研究论文均被他引超过100次,单篇研究论文最高他引超过600次。

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