R Corrplot软件包简介,绘制相关热图 |
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Corrplot软件包简介
介绍
所述corrplot包是相关矩阵,置信区间的图形显示。它还包含一些进行矩阵重新排序的算法。另外,corrplot擅长细节,包括选择颜色,文本标签,颜色标签,布局等。 可视化方法有七个可视化方法(参数method中)corrplot包,命名"circle","square","ellipse","number","shade","color","pie"。 正相关以蓝色显示,负相关以红色显示。颜色强度和圆圈的大小与相关系数成正比。 library(corrplot) ## corrplot 0.84 loaded M 0 ;棕褐色(e i 2 / e i 1)+ π ,除此以外。ai={tan(ei2/ei1),if ei1>0;tan(ei2/ei1)+π,otherwise.Ë 1e1Ë 2e2 "FPC" 对于第一个主成分订单。 "hclust"层次聚类顺序,以及"hclusthod"要使用的聚集方法。"hclusthod"应该是一个 "ward","single","complete","average","mcquitty","median"或 "centroid"。 "alphabet" 按字母顺序排列。 corrplot(M, order = "AOE")如果使用"hclust",则corrplot()可以基于层次聚类的结果在相关矩阵图的周围绘制矩形。 corrplot(M, order = "hclust", addrect = 2)如上节所示,可以自定义相关图的颜色。该功能colorRampPalette()非常便于生成色谱。 col1 |
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