猫咪两只眼睛颜色不同通常是基因决定的，少数是由于后天得病变造成的。 先天性的异瞳是由全白或加白基因引起的。如果加白基因正好侵袭到了控制眼色素基因的位置，就会形成蓝色的眼睛，另一只眼睛没有侵袭到的话就是黄色的眼睛。全白基因跟猫咪耳聋有重大关系，大约75%异瞳的猫咪蓝色眼睛那侧的耳朵是听不见声音的。但由重点色引起的眼睛蓝色如金点、银点等猫咪，耳朵是正常的。 如果猫咪之前眼睛颜色是一样的，后天会因为生病、受伤等原因影响了眼睛虹膜色素细胞的生成，因此改变了眼睛原有的颜色。