浅表的、早期的、非侵袭性的癌症(Tis、T1a、N0)，如果病变的浅表性质已被超声内镜证实，则可采用内镜下粘膜切除术或内镜下粘膜夹层(通常由三级保健中心的胃肠病学家进行)进行治疗。然而，大部分食管癌患者需行根治切除手术。手术需切除全部肿瘤组织、近端和远端切缘正常组织、所有可能累及的淋巴结以及部分含有食管下段引流淋巴管的近端胃组织。食管癌根治术中需将胃上提行食管-胃吻合，或截取小肠或结肠替代食管。由于食管切除时常切断双侧迷走神经，因此为保证患者有足够的胃排空能力，通常在根治术中需同时进行幽门成形术（即通过手术扩大幽门）。通常75岁以上患者无法耐受这样的大手术，尤其是有潜在心肺疾病患者（心脏射血分数