该建筑和纪念大教堂均由建筑师今井健二设计，而刻有真人大小的 26 位圣人青铜雕像的纪念碑则由雕塑家船越康武 (Yasutake Funakoshi) 设计。

从京都带来处决的六名方济各会传教士和二十名日本信徒中，有三名男孩。据说，因为这里像一座小山，所以被要求作为处决地点。

新近装修的纪念馆展示了自圣方济各到来以来日本基督教的历史介绍信息。珍贵的展览资料，如《圣方济各沙勿略书信全集》、与文绘同类型的16世纪《圣母怜子图》、与隐藏的基督徒有关的绘画《雪白的圣母玛利亚》以及彩色玻璃，二楼还有一个由建筑师今井先生设计的名为“Eiko no Ma”的特别展览室。

教宗方济各于 2019 年访问，并安装了 2021 年教宗访问纪念碑。