R语言统计与绘图:ggplot2包绘制生存曲线 |
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来源:R语言统计与绘图 公众号,做学习分享用。 前言绘制Kaplan-Meier生存曲线需要用到的R包:“survminer”和“survival”;如果没有请安装。 install.packages("survminer") #下载survminer包 install.packages("survival") #下载survival包 library(survminer) #加载包 library(survival) # 加载包 导入数据数据集采用 survival 包的 lung 数据集。 data(lung) # 加载lung数据集 View(lung) # 查看数据集 数据集介绍 ?lung # 查询 lung 数据集信息 数据集变量介绍 lung数据集:NCCTG晚期肺癌患者的生存率。 inst:机构代码 time:生存天数 status:生存状态,1为删失,2为死亡 age:年龄 sex:性别,1为男性,2为女性 ph.ecog、ph.karno、pat.karno为评分,这里用不到 meal.cal:每餐摄入的卡路里 wt.loss:体重下降 拟合曲线 fit |
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