参桂理中丸和附子理中丸在药物组成、功效以及治疗病症上存在明显的差别。参桂理中丸主要由干姜、附子、肉桂、人参、白术和甘草组成，具有温中散寒和祛湿定痛的功效，可缓解腹痛、腹泻、手足不温、寒湿疝气、畏寒呕吐、经行腹痛等疾病。而附子理中丸则含有附子、党参、白术、干姜和甘草等成分，能够温中健脾，并用于治疗脾胃虚寒、脘腹冷痛、呕吐泄泻和手足不温等不同症状。

除此之外，虽然两种药物都有温中作用，但是参桂理中丸针对的是散寒和祛湿，而附子理中丸更加强调健脾和温中。并且，参桂理中丸还有治疗经行腹痛和妇女血寒等特殊病症的功效。

但无论使用哪种药物，都需要在医生的指导下进行治疗，以达到最佳的效果。