前面的答主为什么那么大戾气嘛，明明难得遇到“这题我会”还不脑残的问题，要珍惜啊！

下面回答问题。

首先说“王字旁的字和玉有关”这个感觉是对的，但大面积出现在偏旁部首里的“王字旁”实质上并不是“王”字，而是“玉”字。

“王”和“玉”在历史上都有过三横一竖的字形，在汉代许慎所作《说文解字》中，二者字头非常相似，“玉”作为部首时自然也只有三横一竖，即使是现在加了点的“璧”字，《说文》字头中的下半部分也只有三横一竖，并没有点。到宋本《广韵》中，“玉”字的字头在中间短横旁“加点以别王”，才有了今天的“玉”字的模样。（广韵中另有一“玉”为姓氏，读音有别，不在此做讨论。）

《说文》解释，“王”字表示“天地人三者的贯通”，而“玉”的字源，许慎给出的解释是“像三玉之连”。（但以“玉”祭祀古已有之，“灵”字也是玉部，意思是“用玉来祭祀神明的巫者”，从这个角度来说也是“沟通天地人”的存在，字形相似很正常。——这句是我的推测，没有找到证据支撑）

在《说文》中，以“王”为部首的字只有“闰”和“皇”两个字，其余大量的“王字旁”则都是“玉”部，包括各种玉制器物的名称，如璜、琮、珌等。

也有很多题主说到的表示“美玉”的字。

在《说文》中，解释只有“玉也”的字有大约11个，现在比较常见的有一个璐；只有“美玉也”或“玉之美也”的有大约8个，包括瑾瑜、琳、瑶；“石之似（次）玉者也”“石之美者”有二十多个，没有太常见的字。

不过需要注意的是，“琳琅”在《说文》中没有并举，“琅玕”一起表示“像珠子的”。

这些解释近乎一致的字， 我认为在当时区别就不大。如果它们有特指，则会有更多的解释，如“碧”的解释就是“石之青美者”。

（至于为什么会有这么多字义相近读音却差得十万八千里的字我不是很确定）

另外，题主提到的字有一些确实有区别：

琼：赤玉。（《说文》中琼琚并举，琚没有别的意义）

珣：出产于醫無閭的珣玗琪是《周书》所说的“夷玉”，也就是“东方的美玉”。

琦：《说文》没有，《广韵》中只说它是玉的名字。

还有常见但没提到的：

玖：黑色的、像玉的石头

瑕：玉上面的小块红色。（所以“白璧微瑕”才是“有一点遗憾”，它本身没有“瑕疵”的意思）

璀璨：最早是形容玉的光泽的，所以也是“王字旁”。