当敌人身上显示红点时，按下攻击键即可发动忍杀。 根据玩家和敌人所处状态的不同，忍杀动作也会有所不同。 对于未发现玩家的敌人，可以执行“隐密忍杀”，包括背后忍杀、落下忍杀、悬垂忍杀、贴墙忍杀四种； 对于和玩家战斗中的敌人，不能执行隐密忍杀，此时可用的忍杀为正面忍杀、背后忍杀、落下忍杀、对空忍杀、致命忍杀五种。 忍杀属于擒拿攻击的一种，因此忍杀和被忍杀者在动作中均处于无敌状态。

当敌人未发现玩家时（包括警戒槽未出现、出现但未积累满、积累满变为黄色箭头、黄色箭头未完全变红四种），即可对其采取隐密忍杀。 最为基础的是悄悄走到敌人身后，即可看到敌人身上显示红点，此时可以直接发动忍杀，施展“背后忍杀”，并可以趁机发动忍杀忍术。

对绝大多数敌人都可以施展背后忍杀，但是除屏风猿猴外的BOSS均不能被背后忍杀。 若敌人位于玩家下方，则玩家可以选择从空中落到敌人头顶，此下落过程中敌人身上会显示，可以直接发动忍杀，施展“落下忍杀”，落下忍杀时不可发动忍杀忍术。

在所有BOSS之中，幻影破戒僧和宫内破戒僧都可以通过落下忍杀将其击杀或跳过一个阶段。 对于靠近边缘的敌人，玩家可以悬挂在该边缘处，当敌人和玩家的距离足够近时敌人身上会显示，可以直接发动忍杀，施展“悬垂忍杀”，悬垂忍杀时不可发动忍杀忍术。

对BOSS无法施展悬垂忍杀，按照游戏的设计，游戏制作者也没想到可以对精英敌人施展悬垂忍杀。 如果玩家成功对精英敌人施展悬垂忍杀，则其进入第二阶段时不会将HP回满，一般情况下再补一刀即可将第二阶段也打倒。 目前已知可以利用这种方法击杀的精英敌人包括忍者猎人 弥山院圆真和孤影众 枪足之正长。 当玩家贴墙站立，并靠近墙的边缘时，如果有敌人从该位置经过，若敌人和玩家的距离足够近，敌人身上会显示，可以直接发动忍杀，施展“贴墙忍杀”，贴墙忍杀时不可发动忍杀忍术。

对BOSS无法施展贴墙忍杀，对精英敌人可以施展贴墙忍杀，并正常消去该精英敌人一个，敌人满血进入下一阶段。

一旦和敌人开战（警戒槽变为红色），则无法发动隐密忍杀（除对破戒僧的落下忍杀）。 但是如果将敌人的躯干打崩（HP打空时躯干自动崩），则仍可以对其发动忍杀。

一般来说，通过

这三种方式打崩敌人的躯干时，忍杀动作有所不同，不过这三种情况下都可以对敌人按下跳跃键发动失衡绕袭； 如果敌人不是BOSS，则发动失衡绕袭后再忍杀，将发动背后忍杀，并可以趁机发动忍杀忍术，精英敌人只有所有红点都被消除后才能发动忍杀忍术。 当敌人躯干已崩，可以被忍杀时，玩家也可以从高处落下施展落下忍杀。比较常见的情况为秘传·巨型忍者落杀的起跳动作打崩敌人的躯干，然后顺势落下忍杀；以及踩下段破绽使敌人崩躯干后，也可趁势施展落下忍杀。 部分敌人较为特殊，其部分攻击动作由于长时间滞空，本身就具有较大的破绽，此时玩家可以跳到该敌人身边以施展对空忍杀；

并直接将其击杀。 大多数BOSS还需要特殊的“致命忍杀”才能彻底击败，即清掉最后一个红点后，还需要额外做一次处决的动作，此BOSS才会彻底死去。 比较特殊的是屏风猿猴、幻影破戒僧、柔剑 永真三人不需要致命忍杀； 狮子猿两个阶段都需要致命忍杀；无首狮子猿中的黑猿不需要致命忍杀，白猿在致命忍杀后会倒在地上，需要再用不死斩补一次额外的致命忍杀才能彻底击杀（不补这次击杀也能获得经验和战斗记忆以及佛珠，但是无法获得血刀术）；剑圣 苇名一心也类似，致命忍杀后一心会跪坐在地上，需要再用不死斩补一次额外的致命忍杀才能彻底击杀（不补这次击杀就无法获得任何奖励）。

游戏中还有一些忍杀，既不造成伤害，也不能削减敌人的红点，纯粹只是一种表演。 如忍杀白蛇神的所有动作：

第一次戳瞎白蛇的眼睛

取鲜柿子的忍杀第一步

取鲜柿子的忍杀第二步（若不进行此步骤，则白蛇不死，玩家被传送到毒沼的祭奠帮附近）

以及为不死半兵卫和剑圣 苇名一心进行不死介错等，均是表演性质，不造成任何伤害。

一般情况下，忍杀的基础伤害为24000，受到攻击力和紫烟效果的加成，但是不受哼将糖和夜叉戮糖的影响。 当玩家的楔丸带有附魔时，附魔伤害也会加到忍杀伤害中，例如神之飞雪附魔下，忍杀的基础伤害变为24000+20=24020。 一般情况下，敌人的HP都远远小于玩家的忍杀伤害，所以表现为执行忍杀时，直接清空敌人的HP，只有极特殊的情况下才有可能出现忍杀不能清空敌人HP的情况。 对于有多个红点的敌人，即便忍杀未能清空其HP，该敌人仍然会减少一个红点，并补满HP。 此外还有一些特殊情况： 对宫之樱牛发动落下忍杀时，不能令其减少红点（毕竟一共只有一个红点），且忍杀的基础伤害只有1080，受到攻击力和佛糖等的影响。 如一周目新玩家见到宫之樱牛时，玩家为8-10攻击力，对应的伤害倍率为2.75-3.25，实际能造成的伤害为2970-3510，而樱牛此时的HP上限为9573，于是玩家看到的则是对樱牛发动落下忍杀后，削减掉樱牛三分之一左右的HP。 对铠甲武士的忍杀无法削减其HP，只能将其踢开一段距离。

忍杀bug指因为忍杀动作出现错误而导致完整的忍杀动作应当达到的效果（如处决敌人和敌人回血）部分没有达成，将其分为超额忍杀和无效忍杀。

超额忍杀指忍杀虽然清除了敌人的红点，但敌人未能触发回血导致可以连续忍杀的情况 当部分boss或精英敌人被打崩躯干时（有些动作被弹崩也做这个动作），会做出崩躯干动作，等待玩家忍杀；若是被弹崩躯干或被识破崩躯干，则可以利用失衡绕袭使其变为被打崩躯干的动作；这这一动作的后半段，也就是敌人身上的红点快要消失时的一个极短的时间段内，如果玩家对其执行忍杀，则会产生忍杀错位的效果。 具体来说，就是敌人的被忍杀动作本身是带有霸体的，但是在红点消失，敌人即将起身的一个极短的时段内忍杀敌人，则其被忍杀的动作变得可以被打断了，忍杀伤害命中时，敌人不再继续做被忍杀的动作，而是直接按照又受伤一次来判定，并再次做出一个被打崩躯干的动作。由于敌人总是依靠被忍杀动作的后半段来实现回满血，所以此动作被打断就意味着敌人被忍杀并掉了一个红点，但是不会回满血和躯干。 进而导致敌人进入下一阶段时，HP仅剩1点，随便打一下就又崩躯干了。 由于这个时机很难把握，一般玩家会通过失衡绕袭后吃夜叉戮糖来卡时间，是非常精妙的操作

另一种情况则是前述的悬垂忍杀对部分精英敌人的影响，此法也会产生敌人无法回血的情况，但并非其被忍杀动作被打断，而是被悬垂忍杀的动作本身就不能令其回满血（可以算是游戏的疏忽）。 超额忍杀的实质并不是伤害翻倍，而是敌人没有正常回满血，此类为常见邪道汇总。但对于部分敌人，此法并不能加快战斗。如义父受到失衡绕袭被超额忍杀后，即便清空其下一个红点，也必须再次面对他新的一个阶段。（会磕头的巨型忍者 枭也存在此情况，若触发磕头剧情后再度挑战则不会发生。）

无效忍杀指忍杀之后，敌人非但不正常被击溃，反而回复满生命值的情况。 忍杀的基础伤害为24000，受到攻击力的加成。如果攻击力过低导致敌人的HP未能被忍杀清空，则一般敌人、精英敌人、部分BOSS类敌人（包括鬼形部，二阶段狮子猿和无首狮子猿）会恢复全部血量，即便红点被消除也无济于事。例如在八周目1攻击力时，利用鞭炮使樱牛撞墙的方式将变得不可行，因为其会变得无法在血量充足的情况下被直接忍杀。 另一种情况则是对部分最后一个红点的BOSS利用失衡绕袭进行错位忍杀，敌人会被清空红点，但是玩家无法在此之后发动致命忍杀，敌人也会恢复满血，让玩家重新面对一次敌人的最终阶段。（若对幻影破戒僧发动无效忍杀，其会进入“二阶段”并做出释放幻术的动作，并将永远不被击杀。此触发时不一定需要失衡绕袭。） 此外，对于需要特定转阶段效果的敌人（如义父、怨恨之鬼等单位）若其转阶段未完成即发动忍杀，则敌人也会出现红点被全部消除却依旧没有被击杀的情况。