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2024-04-30 01:39| 来源: 网络整理| 查看: 265

2. 微生物群组成与宿主类别和性状相关

为了能够系统地研究微生物群组成和宿主表型之间的关系,研究人员分析了哺乳类、鸟类、鱼类以及爬行类野生动物,包括了不同的动物类别、饮食模式、活动时间、社会结构、寿命和体重,结果发现微生物的组成,多样性和功能基因含量与宿主分类或者性状显著相关——其中一部分微生物群落丰度仅与宿主所处的环境有关,说明它们在适应环境方面具有特定作用;另一方面,某些微生物菌落仅与宿主的分类有关,说明它们可能具有与宿主协同进化的作用,而与生活方式无关。

3. 功能基因的丰度与宿主表型相关

肠道微生物物种组成与宿主的分类与表型密切相关,而当研究人员进一步在功能基因层面进行分析时,发现菌群功能基因的丰度与宿主的进化和分类就没有什么紧密的联系了。PCoA和Mantel 检验表明,动物微生物组的功能景观与生理特征和生活方式特征密切相关,与系统发育无关。

4. 腐肉捕食者微生物群中发现未知毒素代谢基因

野生动物能够靠病原体感染和有毒的食物生存,并对各种疾病表现出免疫力,这些特征可能在很大程度上是由动物的微生物群造成的。为了揭示这种遗传物质所代表的一些潜在功能,研究人员在腐肉捕食者的微生物群中搜索到了可代谢细菌毒素的基因,并通过实验验证了它们裂解细菌毒素的能力,解释了这些适应性是由生活在动物体内的微生物赋予的,也为开发应对人类食物中毒的具有抗菌活性的蛋白药物开发提供了信息。

结论

本研究基于宏基因组组装,构建并注释了来自1209种细菌的5080条基因组,其中75%的细菌是未知物种,极大丰富了微生物群落数据库。

野生动物肠道微生物群的组成和动物类别、饮食模式、活动时间、社会结构、寿命和体重相关,并且与某些类型细菌有共生关系,这些信息不仅提供了野生动物-微生物互作的大量基础信息,也为新的药物及酶制剂的开发提供了潜在的信息。

腐肉捕食者野生动物的肠道菌群中存在能够代谢细菌毒素的基因——解释了为什么它们不会吃坏肚子,同时也为抗食物中毒药物开发提供了可能。

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