新的淋巴瘤分类（成熟淋巴肿瘤国际共识分类和第5版WHO淋巴肿瘤分类）将遗传学作为淋巴瘤诊断的一个组成部分，促使更好的淋巴瘤细分，患者风险分层和治疗反应预测。淋巴瘤存在一些高频疾病特异性突变，大多数亚型具有异质性分子图谱，突变基因很多。其中大多数发生频率较低，反映了淋巴瘤的临床异质性。多项研究识别了改善诊断和预后的分子标志物，NGS正成为临床实验室的重要工具。本综述为淋巴瘤提供了NGS指导。讨论了最常见的成熟淋巴瘤亚型中具有诊断、预后和预测潜力的基因变异，并提出了用于B细胞和NK/T细胞淋巴瘤突变和拷贝数变异检测的靶向测序panel。

研究背景

成熟淋巴瘤（霍奇金淋巴瘤（HL）和非霍奇金淋巴瘤（NHL））是最常见的血液系统实体肿瘤。随着高通量分子检测的开展，对淋巴瘤分子特征的了解加深。淋巴瘤的分类仍然主要基于形态学、免疫表型和一些遗传特征。成熟淋巴瘤的新分类，成熟淋巴肿瘤国际共识分类（ICC）和第5版世界卫生组织（WHO）淋巴肿瘤分类，已经纳入了新开发的技术来改善淋巴瘤分类，分子变异现在是淋巴瘤诊断标准的一部分。

正在使这些高通量技术标准化，以实现其全面和成功的临床应用，但关于测序方法仍然存在很多争议。最关键的问题之一是测序panel的选择和组成。理想的panel应有助于诊断、预后、治疗选择和监测，但要足够小，以便广泛和统一使用。对整个外显子组或基因组进行测序的能力正在稳步增长。尽管如此，定制panel是目前扩大此方法适用性的最可及的选择。这些靶向panel能够以较高的灵敏度和较低的成本深入地分析少量基因。可以使用基于扩增子或捕获的测序panel。基于捕获的panel不仅可以检测单核苷酸变异（SNV）和插入缺失（indel），还可以检测拷贝数变异（CNA）和一些结构变异。然而，结构变异的检测需要进一步改善。此外，样本管理、panel组成、测序程序、生物信息学分析和变异解释的标准化对于开发有用的临床工具至关重要。

本综述旨在总结各种淋巴瘤亚型的重要分子特征，描述与每种亚型相关的基因，大规模测序或NGS panel可包含这些基因。

成熟B细胞淋巴瘤

慢性淋巴细胞白血病

慢性淋巴细胞白血病（CLL）是一种低级别淋巴组织增生性疾病，其特征是血液、骨髓、淋巴结和脾脏中成熟（通常CD5+）B细胞克隆性增殖和积蓄。

超过80%的CLL患者存在一些细胞遗传学异常，根据荧光原位杂交（FISH）检测结果将患者分为不同的风险组：约55%的患者发生13号染色体长臂缺失（del（13q））；12号染色体三体是第二常见的染色体异常（发生率为10%-20%）；约25%的未接受过化疗的晚期患者和10%的早期疾病患者伴有11号染色体长臂缺失（del（11q））；5-8%的未接受过化疗的患者伴有17号染色体短臂缺失（del（17p））。只有del（17p）被认为是显著不良预后因素。CLL中其他常见的异常包括6q缺失（5%）和2p扩增（5-16%）等。

免疫球蛋白重链可变区（IGHV）体细胞超突变（SHM；IGHV序列相似性