磁鼓岛是草帽海贼团进入伟大航路登陆的第三个岛屿。草帽一行人来到了有“医疗大国”之称的磁鼓岛，不巧的是磁鼓岛因为先前统治者的关系，使得岛上只剩下一个医生，那就是住在山上城堡里的“魔女”Dr.库蕾哈，路飞和香吉士背著重病的娜美为此踏上征山之途，途中受到一大群食肉兔拉邦和雪崩的影响，香吉士为了掩护路飞而受重伤，路飞带著两人徒手爬上Dr.库蕾哈所在的磁鼓山，但由于穿著单薄导致严重冻伤晕倒，三人一起接受了Dr.库蕾哈的治疗，并在此遇见了她的助手，一只蓝鼻子的驯鹿托尼托尼·乔巴，路飞想拉拢乔巴成为自己的伙伴，但乔巴因为过去的心灵创伤而不愿与人类接触，与此同时，前统治者—海贼团船长"白铁"瓦尔波刚好回到磁鼓岛来抢回他的国家。在经历与瓦波尔的战斗后，乔巴决定和路飞等人出海，乔巴以船医身份加入草帽海贼团。