在玩家击败骷髅王之后，玩家可以完整地探索地牢。这里有许多物品和武器帮助玩家升级，因此，玩家经常在与血肉墙战斗前探索它。

在困难模式之前中，探索地牢通常安排在探索腐化之地或猩红之地之后，探索丛林前后，探索地狱之前。

在困难模式中，地牢会在击败世纪之花之后出现强大的敌人，在石巨人被击败后，玩家会在地牢的入口发现邪教徒。

尽管骷髅王可以在任何时间被击败，但最好使用丛林或腐化/猩红获得的装备，因为这是目前最好的。

地牢位于地图的最左侧或最右侧，位于地下沙漠和丛林的另一侧，位于雪原生物群系的同一侧。如果一侧有沙漠裂隙，地牢就在地图的另一侧。如果在骷髅王被击败之前进入地牢，地牢守卫会在玩家到达地牢深处时杀死玩家。

和丛林一样，地牢的生成速度比普通生物群系更高，所以很容易被敌怪包围。最好稳步前进，移除见到的所有水蜡烛，因为它们会会进一步提高生成速度。玩家不得不面对大量愤怒骷髅怪、诅咒骷髅头和暗黑法师。后两者的攻击能够穿透物块，因此在寻找在寻找掩护时仍需注意。烈焰火轮和尖刺球也会生成。它们无法被杀死，并且即使它们无法直接瞄准玩家，也能造成大量伤害。飞镖机关也比其他生物群系更加常见，所以一开始危险感药水(电脑版、主机版、前代主机版、和移动版)会有所帮助。

与其他生物群系不同，地牢中找到的金箱是上锁的，需要金钥匙来开启。这是地牢史莱姆的固定掉落和其他敌怪的稀有掉落。它们偶尔也可以在木箱中找到，也有小几率在打破罐子时掉落。洗劫时，宝箱中都包含有一件独特武器、钴护盾配饰，有时还会包含次要战利品暗影钥匙，暗影钥匙是开启地狱中暗影箱所需的；以及包含宝箱#洞穴层宝箱的一般拾取物。特殊宝箱的拾取物是按顺序生成的，所以如果玩家错过了一些物品，最好确保没有遗漏早前的房间或者道路岔口（见讨论）。

玩家可能还会找到受缚机械师。右键点击即可解救她，之后如果有空房屋，她将搬入空房屋。如果她在释放后被杀死，她会像其他 NPC 一样重生。她会提供宏伟蓝图的大部分制作材料，允许玩家完全掌控电路。

随着世纪之花被击败，地牢会变得危险得多。首次击败时会出现状态讯息“地牢中回荡着尖叫声……”，并且更强大的敌怪开始生成。此外，任意生命值大于 100 的敌怪死亡时有小概率生成地牢幽魂，击杀后会掉落灵气。这种新材料可用于制作幽灵盔甲，这是月亮领主击败前法师最好的盔甲。它也能用于召唤南瓜月和霜月。此前发现的生物群系宝箱现在可用对应的钥匙打开。

和其他困难模式环境一样，前往前最好事先做好准备。先前往丛林神庙击败石巨人不是一个坏主意，因为这个Boss难度并不高，但会掉落非常好的武器和配饰。

为了快速到达地牢，最好使用矿车轨道或者传送机。推荐挖掘一条隧道直达地牢的主体部分，这样可以跳过入口通道。谨慎选择刷怪地点，尽量靠近入口，以便在死亡后重新拾取掉落物品。该地点应该做好保护措施，避免怪物生成在周围。最后且重要的一点，选择一个砖墙、板墙和瓷砖墙或多或少分布均匀的地方，让敌怪均匀生成（见下文）。

敌怪生成基于区域内的背景墙。一种墙类型包含其独有的装甲骷髅、法师敌怪和骷髅所使用的远程武器变体种类。也有很低的几率，会生成另一种墙类型的敌怪。

骷髅李和巨型诅咒骷髅头会出现在全部墙类型前。前者机动性高并且能造成大量接触伤害，使得非远程战斗变得危险。后者类似于普通诅咒骷髅头，但增加了发射射弹的能力，它们会对击中目标施加诅咒减益。