1、毛细管气相色谱柱效较高，分离能力较强，分析速度较快；其自身的缺点：柱容量小。2、由于柱容量小，分析时一般采用分流进样的方式，以免浓度过大，造成柱子过载。3、气相色谱气化室的温度设定应该与目标分析物相匹配。一般温度都设在250摄氏度左右，保证目标物能够气化。而柱温大部分采用程序升温，就是温度按照一定的速率往上升。一般柱温经程序升温后的最高温度应该高于进样口温度10-20度，使得从进样口气化的高沸点化合物能够完全流出，减少对柱子的污染。