技术开发局内忙作一团，不断有虚被消灭的消息传来，阿近察觉到了一丝危险，涅茧利队长意识到了灭却师的存在。龙之介与志乃被派往虚经常出现的空座町，代替车谷善之助守卫空座町，龙之介因为代理死神的存在对这次任务漫不经心，遭到了志乃的教训。二人到达空座町，志乃提议分头行动，不等龙之介反对就离开了。伴随龙之介的抱怨，巨大的虚出现在了她眼前，在寻求志乃帮助的途中，却看到了被杀死的志乃，龙之介也倒在了血泊中。闪过一道白光，死神代理——黑崎一护拯救了龙之介，伴随着石田雨龙的吐槽以及井上织姬的关心，空座町四人组都出现了。第二天，伤愈的龙之介看到了身旁安然无恙的志乃，激动不已，却被志乃教训。一片祥和的气氛中，一个穿着奇怪的破面突然出现在了一护的床上，自称伊邦。几人对此并没有什么反应，只是一护与伊邦在外面进行了战斗，一护称其为破面，伊邦却神情奇怪，帅气地拿出了五芒星，进行了归刃。战斗中，伊邦不断刺激着一护，一护也如其所愿准备进行卍解。卍解过程中，伊邦身边出现了奇怪的图案，开始吟唱起来，一护的手臂也被禁锢住了。一护斩断了束缚，向伊邦释放了月牙天冲，受到攻击的伊邦奇怪为什么一护的卍解没有被夺走，一护却根本不明白他在说什么。一道黑影突然出现，伊邦消失在了黑影中。流魂街西六十四区，斑目一角与绫濑川弓亲调查发现这里一个居民都没有了，而且出现了许多中断的足迹，一切都很奇怪。静灵庭内，一伙无面人找到了山本总队长，声称要发起战争，一番队副队长雀部长次郎遭到巨矛贯穿身躯，无面人们扬言，五日后尸魂界将遭到无形帝国毁灭。无面人们不愿告诉山本总队长自己的身份，随后在黑影中离去。奄奄一息的雀部副队长艰难的爬起来，想要汇报什么。

虚圈内，领头的无面人卢达斯摘下斗篷，对失败的伊邦冷嘲热讽，却突然被去掉了右臂，受到了王座上友哈巴赫的教训，卢达斯艰难的坐在地上，要向友哈巴赫汇报什么。友哈巴赫对卢达斯的行为很不满，认为他没有资格诉说未来，抹去了他，随后在伊邦的感激声中抹去了伊邦。友哈巴赫走向高处，看到被囚禁的赫利贝尔，自言道，虚圈不过是进攻尸魂界的基石罢了。空座町内，众人得知了雀部副队长牺牲的消息，任务中的龙之介与志乃被召回参加葬礼。一护略显急躁，外出巡逻，却遇到了从天而降的妮露，妮露大哭，请求一护救救虚圈。众人商议前往虚圈，石田雨龙因灭却师的身份不再前往，退出了本次行动。浦原喜助送上助攻，几人一同到达了虚圈。井上感觉不到活人的存在，一护决定出发寻找目标。狩猎部队在虚圈内行动着，狩猎队长基路杰·欧丕（J. Jail）却被几个破面盯上了，原来她们曾是赫利贝尔的三位副官。一护在妮露的提醒下赶到了战斗处，三位副官都已被基路杰打败，基路杰解开了一护的疑问，告诉了一护自己灭却师的身份。友哈巴赫也得知了特记战力一护的到来，率众人开始前往尸魂界。静灵庭内，十三个番队队长召开会议，确认了贼军的身份为灭却师，并且拥有着封印卍解的能力。会议结束后，众人仍对反常现象感到疑惑，涅茧利私下对山本总队长解答了疑惑，这些消失的平民，都被用来平衡消失的虚了。而这一切，都是因为总队长在千年前未能杀死那个男人。战斗中，一护感叹基路杰比石田要强很多，基路杰却说，那是不可能的。基路杰准备展现灭却师的最终形态，展示出了手上的五芒星，变为了灭却师完圣体。面对完圣体的基路杰，一护的月牙天冲都有些不起作用，基路杰吸收了周围的灵子，准备给一护致命一击，却被犽翁阻挡。犽翁是由赫利贝尔的三位副官使用左臂制造出来的怪物，犽翁重伤基路杰，迫使其使用了“圣隶”，即灵子的绝对隶属。后犽翁被基路杰吸收，副官三人败下阵来。关键时刻，一护参战，并使用卍解。静灵庭内，死神们进行着守卫，谈论着灭却师的过去，普通死神们谈论起百年前的战争显得格外微妙，友哈巴赫却出现在了空中，这里已经是遮魂膜的内侧了。战争全面开始了，无数道火柱在静灵庭内闪过。三番队的四人捕捉到了一束灵压，准备出手，吉良却是一击就被打穿了。普通死神们在灭却师们面前变得不堪一击，情况变得很危险。三番队队长凤桥楼十郎感觉到了吉良灵压的消失，与面前的纳纳纳·纳贾库普（U.Underbelly）继续战斗。艾斯·诺特（F. Fear）利用恐惧杀死了很多死神，阿散井恋次出现，与艾斯开始对峙，却遭到了偷袭，朽木白哉及时出现，准备铲除敌人。邦比爱塔·芭丝塔拜姻（E）对死神们产生着暴击，七番队队长狛村左阵出手制止了她。类似的场景在静灵庭内一直发生着，白哉使用千本樱破开了艾斯的血装，使艾斯掉落，战场上的四位队长都准备使用卍解，并邀请副队长进行帮助，卍解的四人，在瞬间却感受到了不妙，卍解被夺去了。松本利用天挺空罗将这一消息传达开来，涅茧利抱怨着这群笨蛋。无奈中，阿近准备联系黑崎一护。一护的代理器在现世，而灵压在虚圈，阿近转而联系到了浦原喜助，得知了虚圈的消息。一护与基路杰一直在僵持，浦原喜助起身限制住了基路杰，要求一护前往尸魂界。一护在黑腔中得知了尸魂界的消息，突然一道闪光从身边飞过，封住了出口，这是基路杰拼命设置的牢笼。壶府凛公布了一护将前往尸魂界的消息，众人兴奋不已，阿近却突然发现黑腔内一护的灵压消失了。慌乱中，阿近准备从尸魂界主动联系一护。兕丹坊闯入了技术开发局，似乎被什么控制着，壶府凛也对同伴们进行着伤害，一切都很混乱。被困住的一护很是慌乱，只能听到电话另一边的惨叫，拼尽全力也无法打破这牢笼。虚圈内的基路杰自信的说起自己“监狱”的称号，却被抓住空当的葛力姆乔一刀毙命。失去卍解的白哉面对艾斯很是吃力，不幸中了对手施展的恐惧幻觉，见到露琪亚化成白骨的幻象而受到动摇，遭艾斯·诺特徒手贯穿胸膛。白哉眼前浮现群虫攀爬身躯的幻影，试图持刀砍向对方，反让对手得以趁机解放封存在胸章里的卍解，将其重创成伤。奋起的恋次与露琪亚也不敌对手，受伤倒在废墟中。友哈巴赫与副官感受到了白哉灵压的消失，更木剑八却抱着一具尸体出现在了二人面前。多利斯克·贝尔希（O. OverKill）以压倒性的攻势重创九番队副队长桧佐木修兵，总队长山本元柳斋重国随之而来。元柳斋令冲牙源志郎留守一番队，又对四番队下达“无论发生任何事，绝对不准出动四番队”的命令，在获悉四名队长遭敌方夺去卍解时，亲赴前线作战。此时兴奋的多利斯克，宣称自己就是为了使用雀部的卍解了结他的性命而来，并解放封存在胸章里的卍解“黄煌严灵离宫”企图解决对方，山本元柳斎重国回想起了往事，山本元柳斎重国原名山本重国，于2000年前开宗立派，其流派称为“元流”，教学地点称“元字塾”，山本重国在其中担任总师范一职，那时额上只有一道”丿“字型的伤痕。当时的雀部长次郎不是“元字塾”的弟子，却屡屡前来造访，并立志成为后者的助手，山本重国不堪其扰，更对雀部擅自称自己为“丿字斎“感觉非常厌烦，为打发雀部便让他先领悟卍解再来，结果雀部长次郎仅在一月之内即达成成卍解。山本重国为测试其卍解“黄煌严灵离宫”的力量，与雀部交手，以致额头上留下一道消不去的疤痕，口中虽称其是”小婴儿般的卍解“，但实际认可了雀部。因新伤痕与旧疤交错形成一道“十”字型伤痕，不知何时周遭的人开始称呼其“十字斎”，此后山本重国为了雀部长次郎便给自己取了“元柳斎”之名。 多利斯克此举彻底激怒了痛失副官的山本元柳斋重国，被复仇心切的山本使用斩魄刀“流刃若火”释放的火焰活活烧死，只留下被烈火烧成焦炭的骸骨。山本总队长以及快的速度赶到友哈巴赫处，更木剑八早已被友哈巴赫掐住了脖子。面对偷袭的巴兹比、艾斯·诺特、纳纳纳·纳贾库普，仅仅一击就将三人烧焦。随后山本总队长发动卍解“残火太刀”，将友哈巴赫的剑、弓等武器悉数摧毁，并发动卍解的四个招式，令整个尸魂界陷入极热的状态。在终招“天地灰烬”后，友哈巴赫终于是被杀死。被杀死的友哈巴赫缓缓倒下，喃喃道：对不起 ，友哈巴赫大人。总队长发现了事情的不对，被杀死倒在地上的是替身洛伊德·罗伊德（Y. Yourself），而真正的友哈巴赫却前往了一番队舍下大监狱面见了蓝染后归来。气愤的总队长再次发动卍解，却被友哈巴赫成功夺取，友哈巴赫将总队长上半身斩落。山本回忆起当年京乐春水询问有关于他的画像的疑问，感叹自己再也无法回到此处后便当场死亡。遗体下半身则以屹立不摇的姿态，耸立在满目疮痍的瀞灵廷之中。杀死山本的友哈巴赫在转身时，发现山本被斩落的上半身右臂仍紧握著斩魄刀，压住他的斗篷衣角，于是挥剑断其右臂，用脚践踏对方的头颅，想起曾经不可一世的护庭十三队，友哈巴赫用指尖释放的灵压，将总队长遗体炸成灰烬。护庭十三队主力被尽数消灭，黑崎一护也终于在阿近和自己的努力下赶到了静灵庭。奄奄一息的朽木白哉将尸魂界托付给了他，当友哈巴赫正准备撤退，一护将斩魄刀插在了友哈巴赫面前。在战斗中一护的脖子被友哈巴赫贯穿。友哈巴赫让哈斯沃德把一护带回去治疗，结果发现一护并没有受伤且脖子出现类似静血装的条纹，被月牙天冲近距离击中。友哈巴赫表明一护的灭却师因为基路杰的牢笼发生了觉醒。一护不明白他在说什么，友哈巴赫嘲讽一护连自己母亲的事情都不知道。由于可活动时间将至，友哈巴赫不得不撤退，追来的一护被哈斯沃德斩断天锁斩月。

星十字骑士团撤退后，四番队副队勇音面对巨大的伤亡有些难以接受，受到了卯之花队长的安抚。一护婉拒了花太郎为他疗伤，被涅茧利告知无法修复斩魄刀的消息。一番队队舍内，空气死寂，失去右眼的京乐春水稳住了在场的情绪。众人迎接零番队的驾到，零番队全员只有五人，五人之战力超越护廷十三番队全军。零番队驾到奉命将一护、露琪亚、恋次、白哉、两截的天锁斩月带回灵王宫。一护与浦原、泰虎、织姬通过类似视频聊天的装置进行对话确认留在虚圈的浦原等人平安无事后，便通过志波空鹤的发射装置出发去灵王宫。看着离去的黑崎一护，志波空鹤自言自语着，又提醒着被捡到的银城空吾等人努力训练。一护等人到达了灵王宫。当零番队五人成为零番队成员之后，其骨骼将借由灵王之力重新构架，而这重新构架后的骨骼也就成了进入灵王宫的钥匙——王键！每一位零番队成员在灵王宫中都拥有自己的宫殿，其宫殿称为零番离殿，每一个成员的零番离殿名称也有所不同。在麒麟寺天示郎的带领下，一护等人首先前往麒麟殿的“白骨地狱”温泉中接受进一步的治疗，露琪亚，恋次，白哉都被诡异的方式治疗着。静灵庭内，京乐春水被任命为了一番队队长。京乐春水前往中央四十六室，力争副队为两人，冲牙源志郎负责实务，伊势七绪负责打理。而后又提议传授更木剑八斩术，却是吓到了众审判官。京乐春水召来了卯之花队长，即初代【剑八】卯之花八千流。一护在被麒麟寺天示郎以拳头试探其伤时，迅速地以一拳反击使对方受了轻伤，随即和恋次、魂一同被弹往曳舟桐生处。曳舟桐生以丰富的食物招待了二人，并告知二人，零番队全员都是基于尸魂界创造出某种事物的人，如此被灵王认同为“创造尸魂界历史”之人才会被进入零番队，曳舟桐生则是创造了“暂时灵魂”。曳舟桐生的平常状态类似于一个大妈，但是食物的制作会消耗掉很多灵力，因此会变成性感的样子。而他们接下来要拜访的则是二枚屋王悦，创造斩魄刀的男人。王悦的凤凰殿里聚集着成群的小姐姐，小姐姐们的热情令几人很是慌乱，王悦迎接了他们，将他们带到了真正的凤凰殿。王悦嘲讽一护与恋次，刚才的那些小姐姐们都是斩魄刀，明明是死神却认不出斩魄刀，难怪会失败。王悦将“天锁斩月”和“蛇尾丸”的刀身敲成碎片，并要求一护等人活着逃出充斥实体化“浅打”的房间，才肯帮助他们修复斩魄刀。更木剑八到达了中央大监狱最下层，卯之花队长已在这里等候多时，卯之花自嘲道，如果不是因为京乐春水，不是罪人的自己是没有机会进入这里的。更木剑八嘲笑道如果不是因为力量，我们都是罪人吧。卯之花露出了颈部的疤痕，这是更木剑八留给她的。剑八叫出了卯之花的八千流之名，与初代十一番队队长开始了战斗。两代剑八的决斗，必有一死，但这是为了训练更木打倒无形帝国不得不做的。卯之花加入护廷十三队之前，是尸魂界史上空前绝后的大恶人，她自诩掌握天下所有的流派和刀流，为自己取了“八千流”的名字。当初代十一番队队长卯之花烈为了寻觅让她中意的猛将，随同部下抵达流魂街郊外的时候，映入眼帘的景象，竟是多名死于剑八的刀下、堆积成山的流魂街平民尸体。卯之花欲上前仔细视察，反遭忽然窜出的剑八持刀刺伤锁骨下方，随后双方展开激烈的对决，被剑八打败，剑八也被砍伤左脸。在这场决战剑八首次体会到战斗的恐惧和喜悦，因而开始对卯之花抱持着敬仰的心态。然而，剑八害怕失去这样一个“敌人”就会失去战斗的乐趣，为了配合卯之花的实力，所以下意识地将自己弱化至与“敌人”相同的水平。二人的战斗愈发激烈，卯之花烈施展了卍解，这令剑八感受到了从未有过的快乐，自己都要被融化了，真正的剑八将要被唤醒。卯之花看到如此投入的剑八，感叹道，这世上唯一能够取悦我的男人啊，随后死在了剑八刀下。剑八怀中的卯之花开心的看着觉醒的剑八，缓缓死去，俏皮的说着，就像个孩子一样。痛苦至极的剑八听到了有人在叫他，原来那是斩魄刀。三天三夜结束了，恋次通过了王悦的考核，而一护却已狼狈的无法站立，王悦宣布一护未能通过他的测验，将其遣送出尸魂界。被遣送回现世的一护发现，一心已经将他的身体从浦原商店搬回家里，转而自行前往鳗鱼屋，为先前屡次旷职的行为向鳗屋育美致歉，并接受对方的招待，借此沉淀自己的心情。死神状态的一心找到了一护，一护借用育美雨伞与一心一同返回家中，不慎将代理死神许可证留在育美的住处。一心道出自己已经透过浦原的转告，理解一护前往尸魂界期间所发生的事情，并且以一护现在的状态是不可能修好卍解的。一心告诉了一护，他的母亲黑崎真咲，是一名灭却师。黑崎真咲拥有纯正灭却师血统，是黑崎家仅存的末裔，在同样身为灭却师遗族的石田家长大，从小接受灭却师的训练，还一度因为对方家庭的安排，和石田龙弦论及婚嫁。志波一心出身于尸魂界前四大贵族之一的志波家族，为分家的当家大人，护廷十三队十番队队长，亦是志波海燕、志波空鹤的伯父，当时的松本乱菊和日番谷冬狮郎则是其所属番队的副队长和第三席官。他在任职队长的期间，便极为欣赏冬狮郎的工作效率和认真负责的态度，还直言对方会是成为继任十番队队长的最佳人选。一心透过冬狮郎呈报的报告书，得知鸣木市接连发生驻现世死神遭不明对象袭击杀害的案件，因为顾及此次任务的危险性甚高，决定独自抵达现世进行调查。实则此事件是蓝染为了找出假面军势的藏身处，利用改造的虚将驻现世死神当成实验对象的计划。一心在雨天遇上实力极为强劲的虚白，虚白是以死神灵魂为基础完成的虚，战斗中，却遭忽然现身的蓝染等人从背后偷袭而身受重伤，此时灭却师黑崎真咲现身击退了虚白，还亲自为他疗伤，双方因为这项契机而邂逅了彼此。但随后黑崎真咲开始了虚化，龙弦为救真咲四处寻找黑崎一心。找寻到黑崎一心后，对真咲的伤势依然手足无措，这时浦原喜助出现，提出了牺牲黑崎一心死神能力来救治办法，一心在浦原喜助的帮助下与黑崎真咲“连接”，从而丧失了死神的力量。真咲虽然得救了，但龙弦仍为真咲经历的事情感到伤心。真咲完成高中学业没多久，离开了石田家，与留在现世开诊所的一心结为了夫妻，龙弦也迎娶当时在石田家担任侍女的片桐叶绘为妻。九年前进行了“圣别”，即友哈巴赫推动的灭却师选拔 ，灭却师的传说中，被封印的王九百年取回心跳，九十年取回理智，九年取回力量，友哈巴赫为了取回力量，从自认为“不净”的混血灭却师身上夺去了力量，石田雨龙的母亲片桐叶绘是混血灭却师，又因身体虚弱丧失了性命。真咲因曾经虚化也被夺去了力量，遭到Grand fisher攻击丧命。友哈巴赫是灭却师的始祖，所有灭却师体内都流淌着友哈巴赫的血。一护顿时明白了为何友哈巴赫会称其为吾儿。知道一切真相的一护走出家门，从登门拜访的育美手里取回代理死神许可证，他亲自谢过一心和育美的协助，旋即被王悦创造的实体化斩魄刀“梅菈”再次带往凤凰殿，正式在所有向他俯首下跪的浅打里，选出属于自己的浅打，令二枚屋王悦同意为他重铸一把全新斩魄刀。斩魄刀的打造中，王悦告知了一护斩魄刀的真相为虚，而迄今为止伪装成斩魄刀的男人，则是千年前的友哈巴赫。一护不敢相信，亲自去问斩月大叔，在斩月大叔的认同声中，一护内心的建筑都崩塌了。斩月大叔告诉一护，迄今为止保护他的，教会他战斗的，都是虚。而这形象不过是灭却师力量的体现。一护认清了自我，这力量也得到了解放。新的斩月，两种守护。虚圈内，无形帝国再次集结，友哈巴赫在众人面前请出了石田雨龙，认定其为继承着，并授予了与自己相同的字母A。此举受到了很大争议。石田雨龙对此也很不解，友哈巴赫却回答，他是唯一在 “圣别”中无恙的混血灭却师，拥有着超越他的力量。副官哈斯沃德（B. The Balance）看清了友哈巴赫的想法，认为这混乱是刻意制造的，此举会将所有人的目光引向石田雨龙，而石田雨龙也别无他法的将自己献给了陛下。尸魂界内，静灵庭缓缓消失在了无形帝国中，友哈巴赫将以九天取回世界。千年前被打败的友哈巴赫逃亡到了尸魂界，在静灵庭的影子中构筑灵子空间，因此称为无形帝国。金闪闪的涅茧利队长一语道破这机密，声称自己将研究室打造成了无影模式，借此防范敌方突袭。毕·杰·奈因（K）杀死了大前田的妹妹，碎蜂参与了战斗。在之前的入侵中，正是毕·杰·奈因夺走了碎蜂的卍解。碎蜂的瞬哄在与夜一战斗之后便已完成，碎蜂用“无穷瞬哄”，一击将敌人击倒，但并未造成严重伤害。另一边，冬狮郎与副队长松本乱菊迎击巴兹比(H. Heat)，巴兹比被日番谷冬狮郎以真空冰刃贯穿，但未死，狂妄地说出了被山本总队长火焰烧过的星十字骑士团成员包括自己全都还活着的原因。在日番谷冬狮郎欲用绫阵冰壁牵制自己时，巴兹比施展燃火之指1将日番谷冬狮郎连人带冰壁贯穿。随后马不停蹄地追击受伤的日番谷冬狮郎，先后施展燃火之指1与燃火顿足将日番谷的冰雾轻松化解，之后更破解了日番谷设下的陷阱六衣冰结阵，并以燃火之指2重创日番谷，断其斩魄刀。巴兹比正欲了结奄奄一息的冬狮郎时，苍都（I. Iron）打断了他，苍都称要以从日番谷冬狮郎手中夺来的卍解给予日番谷冬狮郎致命一击。