个顶个有用!PubMed 查全查准:布尔逻辑、截词符、标识符、MeSH主题词检索技巧 |
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对于文献检索,个人觉得最重要的就是:用最短的时间找到自己想要的文献,同时能够精准筛选。 在众多网站中,Pubmed 想必是大多数人步入科研时接触的第一个文献检索网站,目前来说也是使用率最高的。 但是大家常用的单一关键词简单检索,会导致查不全漏掉关键文献或者是查得范围太大导致文章成千上万难以筛选。 今天一起学习用PubMed高级检索,利用布尔逻辑、截词符、MeSH主题词等检索技巧快速、全面、精准的找到自己想要的文献! 除了pubmed之外,还有其它数据库的检索技巧,大家有需要的可以学习以下视频教程! ![]() 一、自然语言检索(自由词检索) 以“Lung cancer”为例进行自然语言检索。 1、布尔逻辑运算式(AND) 1个检索词的检索容易理解,这里不做举例。 多个检索词,可以用布尔逻辑运算式(AND)。 当2个单词时,系统默认空格为AND检索。词组与词组的组合,可以写出AND, 注意,所有运算符需大写。 AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。 如检索一个检索词:Lung cancer ![]() 补充:布尔逻辑运算 最常用的3种布尔逻辑运算是AND,OR和NOT,下面会举例OR和NOT。 ![]() 2.布尔逻辑运算式(OR) 检索至少含一个关键词的数据,用于检索同义词或者词的不同表达。 OR提供的运算方式即将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。 如检索:Lung OR cancer ![]() 3.布尔逻辑运算式(NOT) 排除含某一特定关键字的数据。NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。 如检索:Lung NOT cancer ![]() 4.截词符 PubMed 允许使用 * 号作为通配符进行截词检索。(这里的截就是字面意思,可以理解为截断) 如检索:键入bacter*。 系统会找到那些前一部分是bacter的单词(如:bacteria、bacterium等单词的前一部分就是bacter),并对其分别进行检索。 ![]() 补充:截词检索 截词检索有两种分类方式。 按截断的位置来分:有后截断、中间截断、前截断三种类型; 按截断的字符数量来分:可分为有限截断和无限截断两种类型。 这里有限截词是指明确截去字符的数量,而无限截词是指不说明具体截去多少个字符。
不同的检索系统对截词符有不同的规定,有的用「?」,也有的用「*」「!」「#」「$」等。如:「?」出现在词中,「?」或「??」分别表示该处可填入1个或2个任意字符。「?」出现在词尾,如果有「???」,表示该处可填入0-3个任意字符。 常用的有「?」和「*」
另外值得注意的是,在中文数据库中,截词一般在词尾;在英文数据库中,截词不但可在词尾,还可用在词头或中间。 5.强迫短语符 注意:这里需要和第1点中举例的布尔运算逻辑AND区分开来。 强迫短语符的意思就是,用双引号来强制系统进行短语检索。加了引号就是告诉系统,按照词组进行检索,不是词组的我们就不要了。 如检索:输入加双引号的“Lung cancer”(不再自动转换匹配和扩展检索) 这里可以发现,比起我们第1个Lung cance搜索结果,由433522篇缩减范围到210864篇,筛走了不少文献。 ![]() 6.检索字段标识符:[tag] tag指代字段名称。 如对某位大牛感兴趣,检索他的文献时,著者姓名:姓在前,名首字母在后,限定加字段符, 下方是【附常用标识符表】,用好标识符,你的文献检索结果会更精准。 ![]() 如:检索 Robert A[AU],就会出来以精准到作者的Robert A所著文献。 ![]() 7.高级筛选检索 高级筛选检索用起来更方便,可以通过一系列的筛选条件进行筛选,像是我们第6点【检索字段标识符:[tag]】中说的字段,在高级检索中都有。 高级筛选有两个入口。 ①第一个入口:通过advanced按钮进入。 通过组合筛选条件进行文献检索。 限定条件就是作者、标题、作者单位这些。 条件逻辑也很好理解,就是在前面说的,AND\OR\NOT三个运算式。 可以组合多个条件进行筛选,用AND\OR\NOT组合。 ![]() 如下图所示,就是用字段和作者名结合的方式进行检索。 用高级检索的好处就是不用自己记标识符以及不用自己手打运算式。 或者你想用作者单位+作者的组合方式,也可以在这里实现。 ![]() ②第二个入口:搜索之后的界面,在左侧的选项。可以勾选所需要的限定条件。 如你想找综述类的文章,就可以在侧边的article type下找到review ![]() ![]() 二、MeSH主题词表检索(精准检索) Mesh 检索即主题词检索,通俗地讲就是 NLM 编制了本主题词字典,然后我们根据标准化的主题词进行检索,既能提高查全率,还能提高查准率。 以“Lung cancer”为例进行MeSH主题词表检索。 ![]() 1、主题词 进入Pubmed的MeSH database检索界面:输入Lung cancer后,确定主题词。 ![]() ![]() 进入Pubmed的MeSH database检索界面:选择所需要的副主题词。 勾选好所需副主题词后(如:therapy),构建检索式。 点击右上角如图所示的输入框,选择Add to search builder,然后再点击Search Pubmed 大家看下Add to search builder框内大概就是MeSH主题词检索是什么意思了,类似与主题词+副主题词的检索方式,这样的组合可以多个,以AND\OR\NOT三种运算式检索。 ![]() 完成检索后我们点击搜索框下的Advanced,就可以自动保存此次检索历史。 ![]() 我们可以看见History and Search Details下,序号为#14的检索历史,就是上一步中 MeSH 主题词检索结果。 ![]() 3、自由词 自由词(款目词),就是主题词的同义词或相关词,在款目单元的各种成分中,一款目中起标目作用的词称为款目词,作用是将自由词引见到主题词。 自由词可以作为自由检索的关键词。 自由词检索也就是本文第一部分中说的各种检索方式了。 ![]() Mesh 的检索方法准确度高,能将筛选的文献最大限度的缩小范围,而且还可以根据需求选择治疗、预后、不良事件等限定条件,是在精准搜索文献中最常用的检索方式。
三、【MeSH 主题词】+【自由词】组合 History and Search Details的作用不仅仅是查看历史检索记录,还可以将历史检索记录进行合并检索。
比如将「MeSH 主题词」+「自由词」两个检索结果进行结合,或者「MeSH 主题词」+「MeSH 主题词」,用AND\OR\NOT三种运算式检索。举一反三,你想怎么结合就怎么结合。 这样做的目的就是把我们想查的文献查全差准。
在History and Search Details的对话框,合并历史记录#14和序号#15。 点击历史记录#14旁边的三个小点,选择「Add query」; 点击历史记录#15旁边的三个小点,运算式我们选择OR,尽量查全。 ![]() 最后我们看到 Query Box,点击「Search」,结果显示 358391篇文献。 这里就是把两条检索记录下检索到的文献进行去重合并了。 ![]() 案例仅为了方便展示教学所用,最终是希望大家能够掌握方法,融会贯通,学以致用! ![]() ![]() |
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