薛城区疾病预防控制中心成立于2004年5月，其前身为薛城区卫生防疫站，隶属于薛城区卫生健康局，是从事基本公共卫生服务的公益性事业单位。

中心现有业务用房1740平方米，其中实验室793平方米。现有干部职工66人，其中高级职称5人，中级职称20人。根据编办要求设置16个股室，其中管理股室3个，业务股室13个，分别为办公室、财务室、物资药械室、质量控制室、基本公共卫生服务疾控项目管理室、传染病防控与卫生应急管理室、慢性病防治室、免疫规划室、宣传与健康教育室、艾滋病防治室、结核病防治所、地方病与寄生虫病防控室、消毒与病媒生物防治室、食品安全与环境卫生监测室、职业卫生监测室、卫生检测室。主要承担：传染病、寄生虫病、地方病、非传染性疾病等预防与控制；突发公共卫生事件和灾害疫情应急处置；疫情及健康相关因素信息管理，开展疾病监测，收集、报告、分析和评价疾病与健康危害因素等公共卫生信息；健康危害因素监测与干预，开展食源性、职业性、放射性、环境性等疾病的监测评价和流行病学调查，开展公共健康和营养状况监测与评价，提出干预策略与措施；疾病病原生物检测、鉴定和物理、化学因子检测、评价；健康教育与健康促进，对公众进行健康指导和不良健康行为干预；疾病预防控制技术管理与应用研究指导等职责。