今年的毕业生应该是6月底离校，但是这位朋友到了九月份终于完善了手上的工作，对这几年来了一个完善的结束，感谢送给我的一方印章，也祝铠明鸣大展宏图。再有就是ggclusterNet功能也完善了90%，剩下的慢慢补充上来，尤其是代码的优化要抽出些时间多和大佬交流，优化。要知道这部分实在是也很头疼。原计划今年将微生物组分析的四个R包够写好，想来想去似乎目前只有easystat和ggClusterNet可以顺利完成，我也会抓紧时间在今年结束的时候至少完成一个包(phyloBiota)功能。

我在ggClusterNet包中加入了一个phyloseq封装的微生物组数据，这份数据来自刘永鑫老师的示例文件。这里直接使用data()提取即可

为什么说是一网打尽呢，我使用了network函数打包了ggclusterNet封装的各种功能，一般情况下网络所需要的内容都基本上囊括了，一条代码即可分析完成网络，并且可以按照分组同时分析完成多组网络。完成多组网络的共同比对和输出。

计算相关矩阵生成边和节点文件保存为Gephi格式；

使用sne中十多种layout方法并用ggplotv出图，组图

计算节点性质

计算网络性质

计算随机网络和样本网络比对，检测

计算zipi

分组网络计算自动保存 先看看出来的结果