前记

一、ggtree的安装

 二、使用ggtree处理nwk文件

1、导入进化树文件

2、绘制简单进化树

 3、重命名进化树分支

4、标识进化树

5、参考链接

后记

都2023年了，才去使用Y叔早在2018年发表的进化树构建利器——ggtree。刚好最近在做基因家族分析，进化树的构建与美化确实有点麻烦，先前使用MEGA11进行了绘制，但图像简陋，于是导出了nwk文件，准备使用其他软件进行美化。这里，我使用ggtree包进行操作。

下方链接：

Bioconductor - ggtreehttps://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ggtree.html打开R语言输入以下代码，进行安装：