鼻咽癌常以颈部淋巴结肿大为主要临床表现，需与其他具有相同临床症状的疾病进行鉴别。

1、鼻咽结核

本病以颈淋巴结肿大为主要临床表现，鼻咽顶壁结节或增生多见。与鼻咽癌难以肉眼区别，只能进行病理活检才能确诊。

2、鼻咽增生性结节

本病在鼻咽镜下可见独立的单个结节或多个结节，表面黏膜呈淡红色，与周围正常黏膜相同。囊性结节病变用活检钳头部轻压时可呈现脐形凹陷，破溃后有液体流出。

3、鼻咽纤维血管瘤

本病好发于青年男性，临床表现为反复大量出血，伴有鼻塞、听力下降、头痛等症状。临床检查可见鼻咽肿瘤呈红色或淡红色，表面光滑为黏膜覆盖，肿瘤外面一般无坏死或溃疡。

4、鼻咽恶性淋巴瘤

鼻咽恶性淋巴瘤也有颈淋巴结转移，而且镜下的瘤体形态与鼻咽癌类似，肉眼无法区别，只有依靠病理活检才能做出明确诊断。

5、颈淋巴结结核

本病好发于青年人，常伴有周围炎症、低热或潮热，也可出现颈部淋巴结肿大。且该病常与癌症共存，故需通过辅助检查手段，排除鼻咽癌、扁桃体癌等疾病。